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如何使用基因富集分析在線工具metascape，相信很多沒有經驗的人對此束手無策，為此本文總結了問題出現的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。
metascape是一個web工具，提供了基因富集分析，蛋白質互作網絡分析等多種功能，對應的文章發表在nature。communications上，
該網站集成了40多個基因功能注釋數據庫，并且提供了多樣化的可視化方式，對于生物學家而言，通過該網站可以輕松的對基因功能進行探索和分析，目前已有451篇文章引用了該工具，其可視化方式如下所示
集成的功能注釋數據庫如下所示
如上圖所示，利用這些功能注釋的數據庫，主要進行以下幾種分析
ID Conversion
Gene Annotation
Enrichment Analysis
Interaction Network Analysis
對于單個基因列表，默認進行富集分析和PP分析，如下所示，輸入基因列表，選定物種, 然后點擊Express Analysis即可
結果包含以下兩種
默認使用GO, KEGG, Reactome, CORUM等多個數據庫進行富集分析，結果如下所示
用柱狀圖的形式展示top15個顯著富集的terms, 示意如下
用網絡圖的形式展示富集到的terms之間的關系，示意如下
提供了蛋白質相互作用網絡圖，并采用MCODE算法對PPI網絡進行聚類，識別其中的subnetwork,即潛在的蛋白復合體，結果示意如下
如果同時輸入多個基因，還額外提供下兩種可視化方式，第一種是多個富集結果的展示，用熱圖的形式進行展示，示意如下
第二種是輸入的多個基因集之間的overlap分析，結果用circos圖來展示，兩個區域之間的lnks連線代表了對應的overlap，結果示意如下
metascape集成的數據庫最多，而且更新的也非常及時。通過自定義分析，可以實現多個數據庫的功能分析。該數據庫目前支持人，小鼠，大鼠等10個物種的基因分析，是一個非常強大的基因功能分析工具。
看完上述內容，你們掌握如何使用基因富集分析在線工具metascape的方法了嗎？如果還想學到更多技能或想了解更多相關內容，歡迎關注億速云行業資訊頻道，感謝各位的閱讀！
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