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這篇文章給大家介紹在線工具TIMER如何使用,內容非常詳細,感興趣的小伙伴們可以參考借鑒,希望對大家能有所幫助。
在線工具TIMER功能及使用
TIMER是用于腫瘤浸潤性免疫細胞綜合分析的在線工具,通過TIMER算法估計六種免疫浸潤細胞(B細胞,CD4+T細胞,CD8+T細胞,中性粒細胞,巨噬細胞和樹突狀細胞)的豐度,其中:
Gene 模塊探索基因表達 與免疫浸潤豐度之間的相關性 ;
選擇癌癥類型,免疫細胞類型,輸入基因symbol之后就可以進行分析。
Survival 模塊探索臨床結果 與免疫浸潤或基因表達豐度之間的關聯 ;
Mutation 模塊探索突變基因 與免疫浸潤豐度之間的相關性 ;
SCNA 模塊探索基因拷貝變異數與免疫浸潤豐度之間相關性 ;
Diff Exp 模塊探索 腫瘤與正常組織之間的差異基因表達;
Correlation 模塊探索 基因之間的相關性 ;
Estimation 模塊通過 TIMER 算法運行用戶的私有樣本。
關于在線工具TIMER如何使用就分享到這里了,希望以上內容可以對大家有一定的幫助,可以學到更多知識。如果覺得文章不錯,可以把它分享出去讓更多的人看到。
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