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超幾何分布的R實現
超幾何分布是統計學中的一種離散分布,它描述了由有限個物件中抽出n個物件,成功抽出指定種類的物件的個數。 也是生物信息學中常用的一種統計分布模型。我們在GO,KEGG的富集分析時就采用的是這個模型。 其數學表達式如下:
其中:
N: 總樣本數
m: 總樣本中“特定類別”的數量
n: 從總樣本中隨機抽取的數量
k: 抽取樣本中屬于“特定類別”的數量
但是我們做統計模型時,統計不是分布概率,而是累積概率,所以計算的p_value 值計算公式為:
對應的R代碼實現為:
1-phyper(k-1,m, N-m, n,)
到此,相信大家對“R語言怎么實現超幾何分布”有了更深的了解,不妨來實際操作一番吧!這里是億速云網站,更多相關內容可以進入相關頻道進行查詢,關注我們,繼續學習!
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