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本篇內容主要講解“如何使用WashU Epigenome Browser可視化hi-c數據”，感興趣的朋友不妨來看看。本文介紹的方法操作簡單快捷，實用性強。下面就讓小編來帶大家學習“如何使用WashU Epigenome Browser可視化hi-c數據”吧!
Washu Epigenome Browser是一款基因組瀏覽器，相比UCSC等基因組瀏覽器，其不僅能夠展示RNA_seq, chip_seq等二維信息，還可以展示Hi-C等三維基因組學數據分析結果，網址如下
http://epigenomegateway.wustl.edu/browser/
該瀏覽器的功能特別強大，本文只是介紹下如何通過這個瀏覽器來展示Hi-C數據，步驟如下
內置了人，小鼠，大鼠等常用物種，在展示信息之前，首先需要選擇對應的參考物種和基因組版本，如下圖所示
選擇好參考物種之后，下一步就是添加需要展示的信息，每個信息稱之為track。 通過導航欄的Tracks進行添加，既可以從公共數據庫選擇，也支持自己上傳數據。這里我們從ENCODE數據庫選擇數據進行展示，通過Public Data Hubs選擇公共數據集， 如下圖所示，點擊右邊的加號選擇感興趣的數據集
在下方提供了數據集的視圖，通過加號展開對應的數據集，然后點擊右側的Assay區域可以進一步選擇數據集
這里我們選擇IM90細胞系相關數據，示意如下
可以多選，這里我選擇了hic和多種組蛋白修飾和CTCF的chip_seq以及RNA_seq的數據即興展示。
默認情況下track的順序是按照導入的依次順序進行排列，通過下圖紅色方框標記的工具集可以調整tracks的排列順序
其次鼠標右鍵點擊對應的track, 可以對其顏色，y軸范圍等進行詳細調整，如下圖所示
簡單調整了每種track的顏色，效果圖如下所示
到此，相信大家對“如何使用WashU Epigenome Browser可視化hi-c數據”有了更深的了解，不妨來實際操作一番吧！這里是億速云網站，更多相關內容可以進入相關頻道進行查詢，關注我們，繼續學習！
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