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如何進行miRNA相關GO和KEGG功能分析，相信很多沒有經驗的人對此束手無策，為此本文總結了問題出現的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。
對于mRNA數據，我們經常通過GO和KEGG富集分析來進行功能分析，對于miRNA數據而言，我們可以通過miRNA對應的mRNA來研究miRNA相關功能。
miRpath是一個在線網站，集成了miRNA靶基因數據庫, 只需要輸入感興趣的miRNA Id, 就可以從靶基因數據庫中獲取miRNA對應的靶基因，然后進行GO和KEGG富集分析
該數據庫中集成以下3個miRNA靶基因數據庫
TarBase
TargetScan
microT-CDS
支持以下幾個物種的GO和KEGG富集分析
Human
Mouse
D.melanogaster
C.elegans
R.Norvegicus
D.Rerio
G.Gallus
該數據庫有以下兩種使用方式
正向檢索功能用于分析指定miRNA的功能，輸入框如下所示
通過Species選擇對應物種，在Add miRNAs框中輸入感興趣的miRNA ID，然后選擇對應的靶基因數據庫即可，kegg pathway運行結果如下所示
這個結果其實就是將輸入的所有miRNA的靶基因集合進行富集分析，點擊details， 可以查看每個miRNA靶基因單獨富集分析結果，示意如下
點擊see genes, 可以查看具體的基因列表，示意如下
點擊pathway union, 通過show heatmap可以得到如下所示的熱圖
這種熱圖反應的是每個miRNA靶基因的富集分析結果，每一行代表一個miRNA, 每一列代表一個pathway, 單元格的顏色該通路下富集的p值決定。
反向檢索功能用于發現調控指定的GO或者pathway下基因的miRNA, 示意如下
我們可以以miRpath作為參考，利用其他數據庫或者自己構建的高質量miRNA靶基因數據來進行富集分析，從而研究miRNA相關功能。
看完上述內容，你們掌握如何進行miRNA相關GO和KEGG功能分析的方法了嗎？如果還想學到更多技能或想了解更多相關內容，歡迎關注億速云行業資訊頻道，感謝各位的閱讀！
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