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這篇文章給大家分享的是有關mir2disease數據庫有什么用的內容。小編覺得挺實用的,因此分享給大家做個參考,一起跟隨小編過來看看吧。
mir2disease是由哈爾濱工業大學開發的miRNA相關疾病數據庫,網址如下
http://www.mir2disease.org/
該數據庫包含了349個miRNA, 163種疾病,3273個miRNA與疾病之間的關聯信息。
對于miRNA在疾病組織中的失調,給出了以下3種模型
miRNA位于致病的基因組位點,比如雜合性缺失LOH
區域等,有研究發現,miR-15和miR-16位于13號染色體的13q14區域,在慢性淋巴B細胞白血病中,該染色體區域會缺失,導致這兩個miRNA的表達量缺失或下調。
miRNA的異常由表觀遺傳引起,包括DNA甲基化與組蛋白修飾,有研究發現,let-7a-3基因的啟動子區在正常組織中是高度甲基化的,在肺癌組織中低甲基化。啟動子區的去甲基化導致具有致癌功能的let-7a-3在肺癌細胞中再度激活,表達量上調。
miRNA在疾病組織中的失調與相關酶的缺失有關系,有研究發現,miR-24和miR-93靶向調控病毒蛋白,在Dicer酶缺失的細胞中,由于宿主細胞miR-24和miR-93的缺失,導致VSV復制增加。
對于miRNA與疾病關聯的每條記錄,會給出miRNA ID, 疾病名稱,檢測方法,miRNA靶基因信息和對應的文獻,和HMDD數據庫的整體架構非常類似。
支持通過以下3種方式對數據庫進行檢索
以miRNA ID
為例,直接點擊search
按鈕,會顯示所有的miRNA, 然后勾選感興趣,可有多選,然后在進行檢索就可以了
檢索結果示意如下
點擊Detail
可以查看詳細信息,示意如下
該數據庫是免費下載的,提供了miRNA靶基因,相關疾病等信息,示意如下
相比HMDD
, 該數據庫中收錄的miRNA與疾病的關聯信息會少一點,但是仍然是一個非常實用的數據庫。
感謝各位的閱讀!關于“mir2disease數據庫有什么用”這篇文章就分享到這里了,希望以上內容可以對大家有一定的幫助,讓大家可以學到更多知識,如果覺得文章不錯,可以把它分享出去讓更多的人看到吧!
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