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這篇文章主要介紹unibind數據庫有什么用，文中介紹的非常詳細，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們一定要看完！
unibind采用了ChIP-eat這個工具對ReMap數據庫中轉錄因子的chip_seq數據進行分析，對于來自JASPAR數據庫中的人類轉錄因子，通過結合chip_seq數據的分析結果和轉錄因子的PWM等模型來準確預測轉錄因子結合位點，該數據庫網址如下
https://unibind.uio.no/
數據分析的流程如下圖所示
該數據庫對來自315個不同組織和細胞系，231種轉錄因子，共1983個chip_seq原始數據進行分析，與hg38基因組進行比對，通過peak calling識別到peak區域，再進一步結合PWM, DNA shape model, TFFM, Bingding Energy model4種模型在peak區間的基礎上進一步預測轉錄因子結合位點。
通過首頁的檢索框，可以根據各種關鍵詞進行檢索
檢索結果如下所示
點擊每個數據集可以查看詳細結果，示意如下
在該頁面，可以下載peak區間，也可以下載TFBS的bed文件和fasta文件。TFBS的bed格式內容如下
JASPAR數據庫只提供了轉錄因子的motif信息，unibind則在此基礎上提供了TFBS的信息，可以看作是對JASPAR數據庫的一個補充，對于轉錄因子研究而言，TFBS信息非常的重要，對于研究轉錄因子調控的靶基因意義重大，所以該數據庫非常的實用。
以上是“unibind數據庫有什么用”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！希望分享的內容對大家有幫助，更多相關知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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