91超碰碰碰碰久久久久久综合_超碰av人澡人澡人澡人澡人掠_国产黄大片在线观看画质优化_txt小说免费全本

溫馨提示×

溫馨提示×

您好,登錄后才能下訂單哦!

密碼登錄×
登錄注冊×
其他方式登錄
點擊 登錄注冊 即表示同意《億速云用戶服務條款》

miRTarBase數據庫有什么用

發布時間:2022-01-15 15:49:27 來源:億速云 閱讀:417 作者:小新 欄目:大數據

這篇文章將為大家詳細講解有關miRTarBase數據庫有什么用,小編覺得挺實用的,因此分享給大家做個參考,希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。

miRTarBase是一個手工收集的,經過實驗驗證過的miRNA靶基因數據庫,網址如下

http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php

如下圖所示,miRTarBase最新版本為V7.0, 于2017年9月15號更新,共收錄了23個物種。4076 個miRNA, 23054 個基因,422517 個靶基因相互作用

miRTarBase數據庫有什么用

通過Browse功能,可以利用以下四種方式瀏覽數據庫中的內容

  1. miRNA ID

  2. Target Gene

  3. Disease

  4. Species


Statistics提供了每個物種對應的miRNA靶基因情況,示意如下

miRTarBase數據庫有什么用

以Human為例,共收錄了2599 個miRNA, 這些miRNA 的靶基因的集合共有15064 個,而人一共有2萬多個蛋白編碼基因,接近80%都受到miRNA的調控,可見 miRNA調控機制的廣泛性和重要性。

對于miNRA-Target Gene , 共有380639 條記錄, 平均每個miRNA有380639 / 2599=146個靶基因, 而每個基因平均受到380639 / 15064 = 25 個 miRNA的調控。

Search功能則提供了多種檢索方式

1. By miRNA

以mirBase數據庫中的miRNA ID進行檢索,示意如下

miRTarBase數據庫有什么用

2. By Target Gene

以Gene Symbol進行檢索,示意如下

miRTarBase數據庫有什么用

3. By Pathway

以kegg pathway通路進行檢索,示意如下

miRTarBase數據庫有什么用

4. By Validated Method

以各種驗證miRNA和靶基因相互作用的手段進行檢索,示意如下

miRTarBase數據庫有什么用

5.  By Disease

以疾病進行檢索,示意如下

miRTarBase數據庫有什么用

6. Advanced Search

高級檢索功能,支持一次檢索多個miRNA或者基因,示意如下

miRTarBase數據庫有什么用
檢索結果如下所示

miRTarBase數據庫有什么用

對于每條miRNA靶基因的記錄, 都會賦予1個唯一的 miRNA-target interactions (簡稱MTs) 編號,比如MIRT000287,對于檢索結果,可以根據實驗證據的可靠性,進行篩選。

miRTarBase不僅提供了高可信度的miRNA靶基因信息,同時也提供了文獻報道的miRNA和疾病之間的相關信息。

關于“miRTarBase數據庫有什么用”這篇文章就分享到這里了,希望以上內容可以對大家有一定的幫助,使各位可以學到更多知識,如果覺得文章不錯,請把它分享出去讓更多的人看到。

向AI問一下細節

免責聲明:本站發布的內容(圖片、視頻和文字)以原創、轉載和分享為主,文章觀點不代表本網站立場,如果涉及侵權請聯系站長郵箱:is@yisu.com進行舉報,并提供相關證據,一經查實,將立刻刪除涉嫌侵權內容。

AI

凌海市| 台中县| 陆川县| 齐齐哈尔市| 兴仁县| 三穗县| 本溪市| 仁布县| 涡阳县| 大埔区| 绍兴县| 南华县| 河曲县| 阳春市| 鲁甸县| 五大连池市| 宁陕县| 香港| 望江县| 江安县| 滦南县| 长寿区| 西畴县| 临夏市| 安多县| 瑞丽市| 广东省| 甘洛县| 分宜县| 普兰店市| 霍州市| 綦江县| 清徐县| 和田县| 安庆市| 博客| 馆陶县| 河北区| 龙州县| 甘肃省| 郯城县|