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本篇內容主要講解“pheatmap NA/NaN/Inf聚類錯誤怎么解決”，感興趣的朋友不妨來看看。本文介紹的方法操作簡單快捷，實用性強。下面就讓小編來帶大家學習“pheatmap NA/NaN/Inf聚類錯誤怎么解決”吧!
pheatmap 繪圖出現報錯信息類似：
Error in hclust(d, method = method) : 外接函數調用時不能有NA/NaN/Inf(arg11)
出現此類錯誤多數情況是數據在繪圖過程中進行處理后 出現NA/NaN/Inf導致無法進行聚類。
其一是原數據中本身存在NA等情況，其二是原數據存在數據完全無變化，但pheatmap()函數中卻選擇了scale參數進行處理。例如其中一個基因（row）數值完全無變化，scale處理將產生NaN 之后外調hclust將無法成功
> A=c(1,1,1,1,1,1,1)
> scale(A)
[,1]
[1,] NaN
[2,] NaN
[3,] NaN
[4,] NaN
[5,] NaN
[6,] NaN
[7,] NaN
attr(,"scaled:center")
[1] 1
attr(,"scaled:scale")
[1] 0
> hclust(scale(A))
Error in if (is.na(n) || n > 65536L) stop("size cannot be NA nor exceed 65536") :
missing value where TRUE/FALSE needed到此，相信大家對“pheatmap NA/NaN/Inf聚類錯誤怎么解決”有了更深的了解，不妨來實際操作一番吧！這里是億速云網站，更多相關內容可以進入相關頻道進行查詢，關注我們，繼續學習！
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