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怎么用GDC下載TCGA腫瘤患者的臨床信息，相信很多沒有經驗的人對此束手無策，為此本文總結了問題出現的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。
在GDC中，對腫瘤患者的臨床信息進行了標準化，分成了以下7個類別
Demographic
Diagnosis
Exposure
Family History
Follow Up
Molecular Test
Treatment
其中有20項臨床信息是必須的，展示如下
在GDC中，臨床信息的下載和普通文件是類似的，在Repository中，數據類型選擇Clinical, 示意如下
當然可以根據Cases的屬性在進行過濾，過濾之后，在右側可以看到文件的列表，示意如下
可以看到，原始的臨床信息采用了XML格式來存儲，在改文件中保存的信息更加全面。將對應的文件添加到Cart中，可以進行下載，示意如下
如果需要下載原始的文件，可以通過點擊Download, 下載manifest文件，通過gdc-client來下載，這樣做需要后期自己讀取XML文件中的信息，在進行整理。
對于臨床信息，同時還提供了TSV和JSON的下載格式，其中TSV格式特別的友好，用Excel打開即可查看，示意如下
列數較多，這里只截取了部分。需要注意，這種方式得到的臨床信息相比XML文件會少一點，但是對于生存分析等常用場景來說，也足夠了。
看完上述內容，你們掌握怎么用GDC下載TCGA腫瘤患者的臨床信息的方法了嗎？如果還想學到更多技能或想了解更多相關內容，歡迎關注億速云行業資訊頻道，感謝各位的閱讀！
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