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這篇文章主要介紹PlantCircNet數據庫有什么用，文中介紹的非常詳細，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們一定要看完！
PlantCircNet數據庫提供了植物相關的circRNA-miRNA-gene構成的ceRNA調控網絡信息，網址如下
http://bis.zju.edu.cn/plantcircnet/index.php
該數據庫包含了以下8個物種的ceRNA信息
Arabidopsis thaliana
Brachypodium distachyon
Glycine max
Hordeum vulgare
Oryza sativa
Solanum lycopersicum
Triticum aestivum
Zea mays
官網包含以下幾種功能
提供了多種檢索方式，基本檢索功能支持輸入環狀RNA來源基因的名字和miRNA的名稱，來查詢對應的ceRNA網絡，示意如下
檢索結果如下所示，不同形狀的節點代表不同的RNA,具體的對應關系可以查看圖例，點擊RNA的節點可以查看該節點的詳細信息
通過選擇物種，可以查看對應的環狀RNA信息，點擊Details可以查看詳細信息，示意如下
blast用于將輸入的查詢序列與數據庫中的環狀RNA序列進行比對，示意如下
提供了環狀RNA對應的gtf文件和fasta序列文件，以及ceRNA列表供下載，示意如下
該數據庫是第一個植物方面的ceRNA調控網絡數據庫，研究植物的ceRNA可以參考該數據庫。
以上是“PlantCircNet數據庫有什么用”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！希望分享的內容對大家有幫助，更多相關知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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