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circR2Disease數據庫有什么用

發布時間:2022-01-17 09:51:00 來源:億速云 閱讀:165 作者:小新 欄目:大數據

小編給大家分享一下circR2Disease數據庫有什么用,相信大部分人都還不怎么了解,因此分享這篇文章給大家參考一下,希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲,下面讓我們一起去了解一下吧!

從名稱可以看出,circR2Disease是一個疾病相關的環狀RNA數據庫,網址如下

http://bioinfo.snnu.edu.cn/CircR2Disease/

該數據庫中包含以下3個物種的相關信息

  1. human

  2. mouse

  3. rat


最新版收錄了661個環狀RNA,100種疾病,739個環狀RNA和疾病之間的關聯數據。
通過導航欄的Browser菜單,可以根據以下兩種類型查看相關數據

  1. circRNAs

  2. Diseases


以肺癌為例,結果如下所示

circR2Disease數據庫有什么用

該數據庫中的記錄都是從文獻中整理得到的,如果環狀RNA來自circBase數據庫,會給出對應的超鏈接,否則只會給出文獻中的命名。

和同類型的數據庫一樣,都會給出疾病的名稱,檢測的方式,環狀RNA在患病者中的表達趨勢,相關文獻的pubmed id等信息。

通過這種類型的數據庫,我們不僅可以檢索環狀RNA和疾病之間的關系,還可以構建環狀RNA和疾病之間的互作網絡,示意如下

circR2Disease數據庫有什么用

上圖中矩形代表疾病名稱,圓形代表環狀RNA,通過不斷豐富環狀RNA和疾病之間的網絡,可以對環狀RNA在疾病中的作用有一個更加清楚,深入的理解。

以上是“circR2Disease數據庫有什么用”這篇文章的所有內容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內容對大家有所幫助,如果還想學習更多知識,歡迎關注億速云行業資訊頻道!

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