溫馨提示×
您好，登錄后才能下訂單哦！
點擊 登錄注冊 即表示同意《億速云用戶服務條款》
您好，登錄后才能下訂單哦！
這篇文章主要介紹了circBank數據庫有什么用，具有一定借鑒價值，感興趣的朋友可以參考下，希望大家閱讀完這篇文章之后大有收獲，下面讓小編帶著大家一起了解一下。
circBank對circBase數據庫中人類的環狀RNA數據加以整理,根據序列信息進行了蛋白編碼潛能,miRNA相互作用預測分析,并將所有結果整理成了在線數據庫,方便檢索和瀏覽,網址如下
http://www.circbank.cn/
circBank制定了一套系統的circRNA命名方式,以hsa_circ加上來源基因的名字區分不同來源基因對應的環狀RNA,對于來源基因相同的多個環狀RNA,以數字編號的后綴加以區分,示意如下
通過首頁的檢索框,可以根據circBank Id,circBase id,來源基因名稱,Refseq轉錄本名稱等多種方式進行檢索,檢索結果示意如下
點擊miRNA可以查看相互作用分析的結果,利用miRanda和targetscan兩款軟件預測circRNA和miRNA的相互作用,示意如下
點擊環狀RNA的id,可以查看相關詳細信息
采用CPAT和IRESfinder兩款軟件進行預測,結果示意如下
提供了COSMIC數據庫中相關的突變位點信息
該數據庫中的信息是免費下載的,其分析環狀RNA蛋白編碼潛能, miRNA互作的方法值得借鑒,另外將環狀RNA與SNP, RNA修飾聯系起來的思路,也為環狀RNA研究提供了一個新的視角。
感謝你能夠認真閱讀完這篇文章，希望小編分享的“circBank數據庫有什么用”這篇文章對大家有幫助，同時也希望大家多多支持億速云，關注億速云行業資訊頻道，更多相關知識等著你來學習!
免責聲明：本站發布的內容（圖片、視頻和文字）以原創、轉載和分享為主，文章觀點不代表本網站立場，如果涉及侵權請聯系站長郵箱：is@yisu.com進行舉報，并提供相關證據，一經查實，將立刻刪除涉嫌侵權內容。
