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這篇文章將為大家詳細講解有關TransmiR數據庫有什么用，小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。
mRNA可以翻譯成各種功能的蛋白，其中有一類研究調控蛋白研究的非常火熱，即轉錄因子transcription factor, 簡稱TF,TF參與調控轉錄起始過程，是研究轉錄調控必不可少的一環。miRNA可以與mRNA結合，發揮轉錄后調控功能, 二者都是生物體內調控網絡中的重要組成部分。
對于生物體內的調控關系，研究的比較多的是TF-mRNA, miRNA-mRNA之間的調控。TF其實也是可以調控miRNA的轉錄過程的，而TransmiR就是一個從文獻中整理得到的轉錄因子和miRNA之間調控關系的數據庫，網址如下
http://www.cuilab.cn/transmir
在該數據庫中，將支持Tf-miRNA的證據分成了以下3類
level1
level2
literature
各個層次證據的數據量統計如下
該數據庫覆蓋了多個物種中的TF-miRNA信息，各物種對應的數據量如下所示
通過官網的Search功能，可以根據miRNA或者TF進行檢索，示意如下
點擊對應的TF和miRNA, 可以查看詳細信息，miRNA示意如下
該數據庫與HMDD是同一個團隊開發的，所以在該數據中集成了miRNA相關的疾病信息。
通過Network功能，可以查看TF-miRNA調控關系的網絡圖，如下所示
官網還提供了predict功能，用于預測指定的TF和miRNA之間的調控關系，示意如下
根據TF對應的motif信息，查找潛在結合位點附近的miRNA。
該數據庫的信息是可以免費下載的，通過該數據庫，可以方便的研究TF-miRNA的調控關系。
關于“TransmiR數據庫有什么用”這篇文章就分享到這里了，希望以上內容可以對大家有一定的幫助，使各位可以學到更多知識，如果覺得文章不錯，請把它分享出去讓更多的人看到。
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