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適用于基因組規模的多序列比對工具kalign是怎樣的，相信很多沒有經驗的人對此束手無策，為此本文總結了問題出現的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。
之前提到的clustalo, muscle, mafft 適用于幾千到幾萬條序列的多序列比對，在比較基因組學的分析中，需要對不同基因組的序列進行多序列比對。對于基因組規模的多序列比對而言，之前的工具運行速度上就不夠理想了。
kalign 是一款針對大規模序列的多序列比對工具，無論是運行速度，還是比對的準確度，都令人滿意。
在對應的文獻中，利用測試數據集，評估了不同軟件的運行速度和多序列比對的準確度，結果如下
從速度上看，Kalign遙遙領先，從準確到上看，kalign和muscle, mafft 的準確度非常接近。
kalign支持核酸和蛋白質的多序列比對，軟件的安裝過程如下
wget http://msa.sbc.su.se/downloads/kalign/current.tar.gz tar xzvf current.tar.gz ./configure make
編譯好的可執行文件的名字為kalign, 基本用法如下
kalign input.fa > out.fa
默認輸出fasta格式的多序列比對結果，也支持clustalw, msf 等格式。
看完上述內容，你們掌握適用于基因組規模的多序列比對工具kalign是怎樣的的方法了嗎？如果還想學到更多技能或想了解更多相關內容，歡迎關注億速云行業資訊頻道，感謝各位的閱讀！
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