circos images怎么使用

這篇文章主要講解了“circos images怎么使用”，文中的講解內容簡單清晰，易于學習與理解，下面請大家跟著小編的思路慢慢深入，一起來研究和學習“circos images怎么使用”吧！

image這個block是circos內置的block之一，其配置文件為軟件安裝目錄下的etc/image.conf。內容為

默認的image的配置由兩個文件決定

1. image.generic.conf

2. background.white.conf

image.generic.conf文件內容如下

包含以下幾個屬性

1. dir
   dir指定生成的圖片的目錄，.代表當前目錄

2. file
   file指定生成的圖片的名字，默認為circos.png

3. png
   png指定生成的圖片的格式，yes代表生成png格式的圖片

4. svg
svg指定生成的圖片的格式，yes代表生成svg格式的圖片

5. radius
   radius指定圖片半徑的大小，由于circos是圓形布局，所以用圓的半徑來控制圖片大小，生成的圖片是正方形的，邊長為2 * radius

6. angle_offset
   angle_offset指定起始染色體的偏移角度，默認起始的角度為0度，對應表盤上3點鐘位置，angle_offset = -90 , 第一條染色體位于表盤上12點鐘位置，

7. auto_alpha_colors
   auto_alpha_colors代筆對顏色添加透明度，在原來RGB顏色的基礎上，添加一個alpha透明度屬性，

8. auto_alpha_step
   auto_alpha_step指定透明度的大小，取值范圍0-100, 默認值為5

background.white.conf文件只有一行內容

background = white

指定生成的圖片的背景色，可以看到這里為白色，所以默認生成的圖片背景色都為白色。

在使用時，我們通常只調用系統內置的image的配置文件就可以了，寫法如下

此時image的相關配置就是系統默認配置，當我們想要改變其中某項默認配置時，比如修改背景色為黑色，需要使用*操作符，示例如下

在想要修改的參數后面添加*, 然后重新賦值即可。

對于background, 有兩點需要注意

1.背景色可以設置成透明

寫法如下

background = transparent

2.背景除了可以是顏色之外，也可以是另外一幅圖

寫法如下：

background = background.png

要求背景圖片的格式必須為png，而且大小必須和輸出圖片的大小完全一致。

最后看一個更換背景色的例子

感謝各位的閱讀，以上就是“circos images怎么使用”的內容了，經過本文的學習后，相信大家對circos images怎么使用這一問題有了更深刻的體會，具體使用情況還需要大家實踐驗證。這里是億速云，小編將為大家推送更多相關知識點的文章，歡迎關注！