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linux下Circos怎么安裝

發布時間:2022-01-21 11:22:56 來源:億速云 閱讀:249 作者:小新 欄目:開發技術

這篇文章主要為大家展示了“linux下Circos怎么安裝”,內容簡而易懂,條理清晰,希望能夠幫助大家解決疑惑,下面讓小編帶領大家一起研究并學習一下“linux下Circos怎么安裝”這篇文章吧。

linux下Circos安裝

circos下載地址:http://circos.ca/software/download/circos/

下載后解壓:

tar xvfz circos-0.67-pre4.tgz

然后進去circos-0.67-pre4目錄下的bin目錄

cd  circos-0.67-pre4/bin

檢查所需模塊:

./circos -modules
ok       1.26 Carp
ok       0.40 Clone
ok       2.63 Config::General
ok       3.40 Cwd
ok      2.145 Data::Dumper
ok       2.55 Digest::MD5
ok       2.84 File::Basename
ok       3.40 File::Spec::Functions
ok     0.2301 File::Temp

不是ok的都是缺少的perl模塊,需要手動安裝。

安裝方法為使用perl CPAN安裝這些perl模塊。命令:

 perl -MCPAN -e shell

出現下面提示符,即可繼續安裝。

CPAN[1]>

以安裝Clone模塊為例,install命令安裝,如下:

CPAN[1]>install  Clone

提示安裝成功即可安裝下一個模塊。

如 perl -MCPAN -e shell命令失敗,出現如下情況:

Can't locate CPAN.pm in @INC (@INC
contains: /usr/local/lib64/perl5 /usr/local/share/perl5
/usr/lib64/perl5/vendor_perl /usr/share/perl5/vendor_perl /usr/lib64/perl5
/usr/share/perl5 .).
 
BEGIN failed--compilation aborted.

則需先安裝perl-CPAN,命令如下:

yum install perl-CPAN

注意:

其中GD模塊安裝前需安裝GD作圖庫,命令為:

yum install gd*

有些模塊安裝可能會失敗,這時候可強制安裝:

CPAN[1]>force  install  Clone

所有模塊安裝完后在檢查一遍:

./circos -modules

全部為ok即可。

以上是“linux下Circos怎么安裝”這篇文章的所有內容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內容對大家有所幫助,如果還想學習更多知識,歡迎關注億速云行業資訊頻道!

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