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如何分析KEGG COMPOUND 數據庫，相信很多沒有經驗的人對此束手無策，為此本文總結了問題出現的原因和解決方法，通過這篇文章希望你能解決這個問題。
kegg compound 數據庫存儲了在生命活動中發揮作用的各種小分子，生物大分子和其他類型的化學物質，采用C number 進行標識，比如C00047, 代表L-賴氨酸。除了名稱等信息外，還存儲了該物質的化學結構和其他相關信息；
對于所有compound 的分類詳見 Brite 數據庫
包括有機酸, 脂類， 碳水化合物， 核酸，肽鏈，維生素和輔助因子，類固醇，激素和遞質，抗生素共9大類別；
看下每條記錄的詳細信息，以甲酸C000為例
http://www.genome.jp/dbget-bin/www_bget?cpd:C00058
上面的信息可以分成兩大類：
1.基本信息
| Entry | C Number, 在數據庫中的唯一標識符 |
|---|---|
| Name | 名稱 |
| Formula | 化學式 |
| Extract Mass | 質量 |
| Mol weight | 分子量 |
| structure | 結構 |
2.與其他數據庫的鏈接
| Reaction | 該分子涉及到的的Reaction |
|---|---|
| Pathway | 該分子參與的通路 |
| Module | 該分子參與的module |
| Enzyme | 該分子相關的酶 |
| DB | 第三方數據庫的鏈接 |
Reaction 數據庫存儲的是各種compound 之間的反應，所以會有Reaction的鏈接，比如 R00134
Pathway 數據庫整合了ko, module, reaction, compound 等多個數據庫庫的信息，所以也會給出compound 參與的通路，在通路中，對應的compound 會高亮顯示， 如下圖中紅色標記的圓形。
Module 是ko的集合，但是ko只是基因集，真正參與生命活動的是這些基因的產物，在產物發揮作用的時候，也需要compound 的參與，所有會給出compound 相關的module。
Enzyme 數據庫保存各種酶的相關信息，酶作為催化劑調控一些生物學過程的發生和進行，在這個過程中肯定也會有compound 的參與；比如1.1.1.306 這種酶催化的反應中， 供體提供甲酸才能進行反應，所以會給出compound 對應的Enzyme 編號；
compound 數據庫存儲了參與生命活動的各種分子的信息，數據庫中的記錄用C Number唯一標識， 每條分子都有對應的化學式，結構式，分子量等基本信息；
compound 和reaction , module， pathway， enzeme 等多個數據庫都有聯系；
看完上述內容，你們掌握如何分析KEGG COMPOUND 數據庫的方法了嗎？如果還想學到更多技能或想了解更多相關內容，歡迎關注億速云行業資訊頻道，感謝各位的閱讀！
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