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Paddle模型性能分析工具Profiler怎么使用

發布時間:2023-03-10 13:39:32 來源:億速云 閱讀:266 作者:iii 欄目:開發技術

本篇內容介紹了“Paddle模型性能分析工具Profiler怎么使用”的有關知識,在實際案例的操作過程中,不少人都會遇到這樣的困境,接下來就讓小編帶領大家學習一下如何處理這些情況吧!希望大家仔細閱讀,能夠學有所成!

    Paddle模型性能分析Profiler

    定位性能瓶頸點優化程序提升性能

    Paddle Profiler是飛槳框架自帶的低開銷性能分析器,可以對模型運行過程的性能數據進行收集、統計和展示。性能分析器提供的數據可以幫助定位模型的瓶頸,識別造成程序運行時間過長或者GPU利用率低的原因,從而尋求優化方案來獲得性能的提升

    1.使用Profiler工具調試程序性能

    在模型性能分析中,通常采用如下四個步驟:

    • 獲取模型正常運行時的ips(iterations per second, 每秒的迭代次數),給出baseline數據。

    • 開啟性能分析器,定位性能瓶頸點。

    • 優化程序,檢查優化效果。

    • 獲取優化后模型正常運行時的ips,和baseline比較,計算真實的提升幅度。

    下面是使用神經網絡對cifar10進行分類的示例代碼,里面加上了啟動性能分析的代碼。通過這個比較簡單的示例,來看性能分析工具是如何通過上述四個步驟在調試程序性能中發揮作用。

    1.1 使用cifar10數據集卷積神經網絡進行圖像分類

    import paddle
    import paddle.nn.functional as F
    from paddle.vision.transforms import ToTensor
    import numpy as np
    import matplotlib.pyplot as plt
    print(paddle.__version__)

    加載數據集

    cifar10數據集由60000張大小為32 * 32的彩色 圖片組成,其中有50000張圖片組成了訓練集,另外10000張圖片組成了測試集。這些圖片分為10個類別,將訓練一個模型能夠把圖片進行正確的分類。

    transform = ToTensor()
    cifar10_train = paddle.vision.datasets.Cifar10(mode='train',
                                                   transform=transform)
    cifar10_test = paddle.vision.datasets.Cifar10(mode='test',
                                                  transform=transform)

    組建網絡

    接下來使用飛槳定義一個使用了三個二維卷積( Conv2D ) 且每次卷積之后使用 relu 激活函數,兩個二維池化層( MaxPool2D ),和兩個線性變換層組成的分類網絡,來把一個(32, 32, 3)形狀的圖片通過卷積神經網絡映射為10個輸出,這對應著10個分類的類別

    class MyNet(paddle.nn.Layer):
        def __init__(self, num_classes=1):
            super(MyNet, self).__init__()
            self.conv1 = paddle.nn.Conv2D(in_channels=3, out_channels=32, kernel_size=(3, 3))
            self.pool1 = paddle.nn.MaxPool2D(kernel_size=2, stride=2)
            self.conv2 = paddle.nn.Conv2D(in_channels=32, out_channels=64, kernel_size=(3,3))
            self.pool2 = paddle.nn.MaxPool2D(kernel_size=2, stride=2)
            self.conv3 = paddle.nn.Conv2D(in_channels=64, out_channels=64, kernel_size=(3,3))
            self.flatten = paddle.nn.Flatten()
            self.linear1 = paddle.nn.Linear(in_features=1024, out_features=64)
            self.linear2 = paddle.nn.Linear(in_features=64, out_features=num_classes)
        def forward(self, x):
            x = self.conv1(x)
            x = F.relu(x)
            x = self.pool1(x)
            x = self.conv2(x)
            x = F.relu(x)
            x = self.pool2(x)
            x = self.conv3(x)
            x = F.relu(x)
            x = self.flatten(x)
            x = self.linear1(x)
            x = F.relu(x)
            x = self.linear2(x)
            return x

    模型訓練&預測

    接下來,用一個循環來進行模型的訓練,將會:

    使用 paddle.optimizer.Adam 優化器來進行優化。

    使用 F.cross_entropy 來計算損失值。

    使用 paddle.io.DataLoader 來加載數據并組建batch。

    import paddle.profiler as profiler
    #參數設置
    epoch_num = 10
    batch_size = 32
    learning_rate = 0.001
    val_acc_history = []
    val_loss_history = []
    def train(model):
        print('start training ... ')
        # turn into training mode
        model.train()
        opt = paddle.optimizer.Adam(learning_rate=learning_rate,
                                    parameters=model.parameters())
        train_loader = paddle.io.DataLoader(cifar10_train,
                                            shuffle=True,
                                            batch_size=batch_size,
                                            num_workers=4)
        valid_loader = paddle.io.DataLoader(cifar10_test, batch_size=batch_size)
        # 創建性能分析器相關的代碼
        def my_on_trace_ready(prof):# 定義回調函數,性能分析器結束采集數據時會被調用
            callback = profiler.export_chrome_tracing('./profiler_demo') # 創建導出性能數據到profiler_demo文件夾的回調函數
            callback(prof)  # 執行該導出函數
            prof.summary(sorted_by=profiler.SortedKeys.GPUTotal) # 打印表單,按GPUTotal排序表單項
        p = profiler.Profiler(scheduler = [3,14], on_trace_ready=my_on_trace_ready, timer_only=True) # 初始化Profiler對象
        p.start() # 性能分析器進入第0個step
        for epoch in range(epoch_num):
            for batch_id, data in enumerate(train_loader()):
                x_data = data[0]
                y_data = paddle.to_tensor(data[1])
                y_data = paddle.unsqueeze(y_data, 1)
                logits = model(x_data)
                loss = F.cross_entropy(logits, y_data)
                if batch_id % 1000 == 0:
                    print("epoch: {}, batch_id: {}, loss is: {}".format(epoch, batch_id, loss.numpy()))
                loss.backward()
                opt.step()
                opt.clear_grad()
                p.step() # 指示性能分析器進入下一個step
                if batch_id == 19:
                    p.stop() # 關閉性能分析器
                    exit() # 做性能分析時,可以將程序提前退出
            # evaluate model after one epoch
            model.eval()
            accuracies = []
            losses = []
            for batch_id, data in enumerate(valid_loader()):
                x_data = data[0]
                y_data = paddle.to_tensor(data[1])
                y_data = paddle.unsqueeze(y_data, 1)
                logits = model(x_data)
                loss = F.cross_entropy(logits, y_data)
                acc = paddle.metric.accuracy(logits, y_data)
                accuracies.append(acc.numpy())
                losses.append(loss.numpy())
            avg_acc, avg_loss = np.mean(accuracies), np.mean(losses)
            print("[validation] accuracy/loss: {}/{}".format(avg_acc, avg_loss))
            val_acc_history.append(avg_acc)
            val_loss_history.append(avg_loss)
            model.train()
    model = MyNet(num_classes=10)
    train(model)
    **部分結果展示:**
    epoch: 6, batch_id: 0, loss is: [0.91811454]
    epoch: 6, batch_id: 1000, loss is: [0.89851004]
    [validation] accuracy/loss: 0.7232428193092346/0.8434960246086121
    epoch: 7, batch_id: 0, loss is: [0.60690844]
    epoch: 7, batch_id: 1000, loss is: [0.6912922]
    [validation] accuracy/loss: 0.7049720287322998/0.887704074382782
    epoch: 8, batch_id: 0, loss is: [0.6330824]
    epoch: 8, batch_id: 1000, loss is: [0.5715592]
    [validation] accuracy/loss: 0.7176517844200134/0.8511289954185486
    epoch: 9, batch_id: 0, loss is: [0.29487646]
    epoch: 9, batch_id: 1000, loss is: [0.9094696]
    [validation] accuracy/loss: 0.7097643613815308/0.9166476130485535
    1.1.1 獲取性能調試前模型正常運行的ips

    上述程序在創建Profiler時候,timer_only設置的值為True,此時將只開啟benchmark功能,不開啟性能分析器,程序輸出模型正常運行時的benchmark信息如下

    • Reader Ratio:表示數據讀取部分占訓練batch迭代過程的時間占比,

    • reader_cost:代表數據讀取時間,

    • batch_cost:代表batch迭代的時間,

    • ips:表示每秒能迭代多少次,即跑多少個batch。

    可以看到,此時的ips為70.99,可將這個值作為優化對比的baseline。

     ============================================Perf Summary============================================
     Reader Ratio: 35.240%
     Time Unit: s, IPS Unit: steps/s
    |                 |       avg       |       max       |       min       |
     |   reader_cost   |     0.00496     |     0.00542     |     0.00469     |
    |    batch_cost   |     0.01408     |     0.01325     |     0.01246     |
     |       ips       |     70.99914    |     80.24470    |     75.46403    |
    1.1.2. 開啟性能分析器,定位性能瓶頸點

    修改程序,將Profiler的timer_only參數設置為False, 此時代表不只開啟benchmark功能,還將開啟性能分析器,進行詳細的性能分析。

    p = profiler.Profiler(scheduler = [3,14], on_trace_ready=my_on_trace_ready, timer_only=False)

    性能分析器會收集程序在第3到14次(不包括14)訓練迭代過程中的性能數據,并在profiler_demo文件夾中輸出一個json格式的文件,用于展示程序執行過程的timeline,可通過chrome瀏覽器的chrome://tracing 插件打開這個文件進行查看。

    如圖所示,把json文件load即可:

    性能分析器還會直接在終端打印統計表單(建議重定向到文件中查看),查看程序輸出的Model Summary表單

    -----------------------------------------------Model Summary-----------------------------------------------
    Time unit: ms
    ---------------  ------  ----------------------------------------  ----------------------------------------  
    Name             Calls   CPU Total / Avg / Max / Min / Ratio(%)    GPU Total / Avg / Max / Min / Ratio(%)    
    ---------------  ------  ----------------------------------------  ----------------------------------------  
    ProfileStep      11      138.99 / 12.64 / 17.91 / 10.65 / 100.00   8.81 / 0.80 / 0.80 / 0.80 / 100.00        
      Dataloader     11      16.88 / 1.53 / 6.91 / 0.09 / 12.14        0.00 / 0.00 / 0.00 / 0.00 / 0.00          
      Forward        11      45.18 / 4.11 / 4.41 / 3.61 / 32.50        2.73 / 0.25 / 0.25 / 0.25 / 31.01         
      Backward       11      27.63 / 2.51 / 2.85 / 2.37 / 19.88        4.04 / 0.37 / 0.37 / 0.36 / 45.81         
      Optimization   11      19.75 / 1.80 / 1.89 / 1.61 / 14.21        1.05 / 0.10 / 0.10 / 0.09 / 11.56         
      Others         -       29.55 / - / - / - / 21.26                 1.05 / - / - / - / 11.63                  
    ---------------  ------  ----------------------------------------  ----------------------------------------  
    Note:
    在此表中,GPU 時間是該階段調用的所有設備(GPU)事件的總和。
    與概述摘要不同,如果兩個設備(GPU)事件在不同的流上執行重疊時間,我們直接在這里求和。
    • 其中ProfileStep表示訓練batch的迭代step過程,對應代碼中每兩次調用p.step()的間隔時間;

    • Dataloader表示數據讀取的時間,即for batch_id, data in enumerate(train_loader())的執行時間;

    • Forward表示模型前向的時間,即logits = model(x_data)的執行時間,

    • Backward表示反向傳播的時間,即loss.backward()的執行時間;

    • Optimization表示優化器的時間,即opt.step()的執行時間。

    通過timeline可以看到,Dataloader占了執行過程的很大比重,Model Summary顯示其接近了12%。分析程序發現,這是由于模型本身比較簡單,需要的計算量小,再加上Dataloader 準備數據時只用了單進程來讀取,使得程序讀取數據時和執行計算時沒有并行操作,導致Dataloader占比過大。

    1.1.3. 優化程序,檢查優化效果

    識別到了問題產生的原因,對程序繼續做如下修改,將Dataloader的num_workers設置為4,使得能有多個進程并行讀取數據。

    train_loader = paddle.io.DataLoader(cifar10_train,
                                        shuffle=True,
                                        batch_size=batch_size,
                                        num_workers=4)

    重新對程序進行性能分析,新的timeline和Model Summary如下所示

    -----------------------------------------------Model Summary-----------------------------------------------
    Time unit: ms
    ---------------  ------  ----------------------------------------  ----------------------------------------  
    Name             Calls   CPU Total / Avg / Max / Min / Ratio(%)    GPU Total / Avg / Max / Min / Ratio(%)    
    ---------------  ------  ----------------------------------------  ----------------------------------------  
    ProfileStep      11      89.44 / 8.13 / 8.76 / 7.82 / 100.00       8.82 / 0.80 / 0.80 / 0.80 / 100.00        
      Dataloader     11      1.51 / 0.14 / 0.16 / 0.12 / 1.69          0.00 / 0.00 / 0.00 / 0.00 / 0.00          
      Forward        11      31.67 / 2.88 / 3.17 / 2.82 / 35.41        2.72 / 0.25 / 0.25 / 0.24 / 36.11         
      Backward       11      25.35 / 2.30 / 2.49 / 2.20 / 28.34        4.07 / 0.37 / 0.37 / 0.37 / 42.52         
      Optimization   11      11.67 / 1.06 / 1.16 / 1.01 / 13.04        1.04 / 0.09 / 0.10 / 0.09 / 10.59         
      Others         -       19.25 / - / - / - / 21.52                 1.06 / - / - / - / 10.78                  
    ---------------  ------  ----------------------------------------  ----------------------------------------

    可以看到,從Dataloader中取數據的時間大大減少,從12%變成了平均只占一個step的1.69%,并且平均一個step所需要的時間也相應減少了從1.53到0.14。

    ### 1.1.4 獲取優化后模型正常運行的ips,確定真實提升幅度
    重新將timer_only設置的值為True,獲取優化后模型正常運行時的benchmark信息
    ============================================Perf Summary============================================
    Reader Ratio: 1.718%
    Time Unit: s, IPS Unit: steps/s
    |                 |       avg       |       max       |       min       |
    |   reader_cost   |     0.00013     |     0.00015     |     0.00012     |
    |    batch_cost   |     0.00728     |     0.00690     |     0.00633     |
    |       ips       |    137.30879    |    158.01126    |    144.91796    |

    此時從原來的Reader Ratio: 35.240%---->Reader Ratio: 1.718%

    ips的值變成了137.3,相比優化前的baseline70.99,模型真實性能提升了193%。

    注意點:

    由于Profiler開啟的時候,收集性能數據本身也會造成程序性能的開銷,因此正常跑程序時請不要開啟性能分析器,性能分析器只作為調試程序性能時使用。

    • 1.如果想獲得程序正常運行時候的 benchmark信息(如ips),可以像示例一樣將Profiler的timer_only參數設置為True,此時不會進行詳盡的性能數據收集,幾乎不影響程序正常運行的性能,所獲得的benchmark信息也趨于真實。

    • 2.benchmark信息計算的數據范圍是從調用Profiler的start方法開始,到調用stop方法結束這個過程的數據。而Timeline和性能數據的統計表單的數據范圍是所指定的采集區間,如這個例子中的第3到14次迭代,這會導致開啟性能分析器時統計表單和benchmark信息輸出的值不同(如統計到的Dataloader的時間占比)。

    • 3.當benchmark統計的范圍和性能分析器統計的范圍不同時, 由于benchmark統計的是平均時間,如果benchmark統計的范圍覆蓋了性能分析器開啟的范圍,也覆蓋了關閉性能調試時的正常執行的范圍,此時benchmark的值沒有意義,因此開啟性能分析器時請以性能分析器輸出的統計表單為參考,這也是為何上面示例里在開啟性能分析器時沒貼benchmark信息的原因。

    1.1.5 結果展示
    #結果展示
    plt.plot(val_acc_history, label = 'validation accuracy')
    plt.xlabel('Epoch')
    plt.ylabel('Accuracy')
    plt.ylim([0.5, 0.8])
    plt.legend(loc='lower right')

    2 統計表單展示

    統計表單負責對采集到的數據(Event)從多個不同的角度進行解讀,也可以理解為對timeline進行一些量化的指標計算。 目前提供Device Summary、Overview Summary、Model Summary、Distributed Summary、Operator Summary、Kernel Summary、Memory Manipulation Summary和UserDefined Summary的統計表單,每個表單從不同的角度進行統計計算。每個表單的統計內容簡要敘述如下:

    Device Summary

    -------------------Device Summary-------------------
    ------------------------------  --------------------  
    Device                          Utilization (%)  
    ------------------------------  --------------------  
    CPU(Process)                    77.13  
    CPU(System)                     25.99  
    GPU2                            55.50  
    ------------------------------  --------------------  
    Note:
    CPU(進程) 利用率 = 當前進程在所有 cpu 內核上的 CPU 時間/經過的時間,因此最大利用率可以達到 100% * cpu 內核數。
    CPU(系統)利用率=所有進程在所有cpu內核上的CPU時間(忙碌時間)/(忙碌時間+空閑時間)。
    GPU 利用率 = 當前進程 GPU 時間 / 已用時間。
    ----------------------------------------------------

    DeviceSummary提供CPU和GPU的平均利用率信息。其中

    CPU(Process): 指的是進程的cpu平均利用率,算的是從Profiler開始記錄數據到結束這一段過程,進程所利用到的 cpu core的總時間與該段時間的占比。因此如果是多核的情況,對于進程來說cpu平均利用率是有可能超過100%的,因為同時用到的多個core的時間進行了累加。

    CPU(System): 指的是整個系統的cpu平均利用率,算的是從Profiler開始記錄數據到結束這一段過程,整個系統所有進程利用到的cpu core總時間與該段時間乘以cpu core的數量的占比。可以當成是從cpu的視角來算的利用率。

    GPU: 指的是進程的gpu平均利用率,算的是從Profiler開始記錄數據到結束這一段過程,進程在gpu上所調用的kernel的執行時間 與 該段時間 的占比。

    Overview Summary

    Overview Summary用于展示每種類型的Event一共分別消耗了多少時間,對于多線程或多stream下,如果同一類型的Event有重疊的時間段,采取取并集操作,不對重疊的時間進行重復計算。

    ---------------------------------------------Overview Summary---------------------------------------------
    Time unit: ms
    -------------------------  -------------------------  -------------------------  -------------------------  
    Event Type                 Calls                      CPU Time                   Ratio (%)  
    -------------------------  -------------------------  -------------------------  -------------------------  
    ProfileStep                8                          4945.15                    100.00  
      CudaRuntime              28336                      2435.63                    49.25  
      UserDefined              486                        2280.54                    46.12  
      Dataloader               8                          1819.15                    36.79  
      Forward                  8                          1282.64                    25.94  
      Operator                 8056                       1244.41                    25.16  
      OperatorInner            21880                      374.18                     7.57  
      Backward                 8                          160.43                     3.24  
      Optimization             8                          102.34                     2.07  
    -------------------------  -------------------------  -------------------------  -------------------------  
                              Calls                      GPU Time                   Ratio (%)  
    -------------------------  -------------------------  -------------------------  -------------------------  
      Kernel                   13688                      2744.61                    55.50  
      Memcpy                   496                        29.82                      0.60  
      Memset                   104                        0.12                       0.00  
      Communication            784                        257.23                     5.20  
    -------------------------  -------------------------  -------------------------  -------------------------  
    Note:
    在此表中,我們根據事件類型匯總了所有收集到的事件。
    在主機上收集的事件時間顯示為 CPU 時間,如果在設備上則顯示為 GPU 時間。
    不同類型的事件可能會重疊或包含,例如 Operator 包括 OperatorInner,因此比率之和不是 100%。
    有重疊的同類型事件的時間不會計算兩次,合并后所有時間相加。
    Example:
    Thread 1:
      Operator: |___________|     |__________|
    Thread 2:
      Operator:   |____________|     |___|
    After merged:
      Result:   |______________|  |__________|
    ----------------------------------------------------------------------------------------------------------

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