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Ubuntu怎么將nii圖像保存成png格式

發布時間:2022-11-15 10:12:55 來源:億速云 閱讀:141 作者:iii 欄目:服務器

這篇文章主要介紹“Ubuntu怎么將nii圖像保存成png格式”的相關知識,小編通過實際案例向大家展示操作過程,操作方法簡單快捷,實用性強,希望這篇“Ubuntu怎么將nii圖像保存成png格式”文章能幫助大家解決問題。

系統:Ubuntu 16.04

軟件: python 3.5

先用pip安裝nibabel、numpy、imageio、os。

import nibabel as nib
import numpy as np
import imageio
import os
 
def read_niifile(niifile):   #讀取niifile文件
 img = nib.load(niifile)   #下載niifile文件(其實是提取文件)
 img_fdata = img.get_fdata()  #獲取niifile數據
 return img_fdata
 
def save_fig(file):     #保存為圖片
 fdata = read_niifile(file)  #調用上面的函數,獲得數據
 (x,y,z) = fdata.shape   #獲得數據shape信息:(長,寬,維度-切片數量)
 for k in range(z):
  silce = fdata[k,:,:]   #三個位置表示三個不同角度的切片
  imageio.imwrite(os.path.join(savepicdir,'{}.png'.format(k)),silce)
          #將切片信息保存為png格式
 
dir = './.nii'      #nii的路徑
savepicdir = ''      #保存png的路徑
os.mkdir(savepicdir)     #創建文件夾
save_fig(dir)      #運行程序,保存為圖像

不要忘記返回img_fdata,否則下一個文件會報錯。

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