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如何將.img/.hdr格式轉.nii格式

發布時間:2020-07-01 16:22:20 來源:億速云 閱讀:446 作者:清晨 欄目:開發技術

小編給大家分享一下如何將.img/.hdr格式轉.nii格式,希望大家閱讀完這篇文章后大所收獲,下面讓我們一起去探討方法吧!

MATLAB轉格式,需要使用spm package(https://github.com/neurodebian/spm12).

%%img2nii.m--------------------------------------------
%Script to convert hdr/img files to nii.
%This script uses SPM function, so you need to install SPM5 or later.
%Kiyotaka Nemoto 05-Nov-2014
 
%select files
f = spm_select(Inf,'img$','Select img files to be converted');
 
%convert img files to nii
for i=1:size(f,1)
 input = deblank(f(i,:));
 [pathstr,fname,ext] = fileparts(input);
 output = strcat(fname,'.nii');
 V=spm_vol(input);
 ima=spm_read_vols(V);
 V.fname=output;
 spm_write_vol(V,ima);
end

附加一下volume data是如何轉surface data的吧…

wb_command -volume-to-surface-mapping ArticParcels_Smithetal.nii /home/murphyhuang/tmp/nii/HCP_fMRI/Q1-Q6_R440.L.flat.32k_fs_LR.surf.gii outL.shape.gii -trilinear

補充知識:數據讀取——(.img .hdr)

1、定義

該圖像格式含有兩部分:一個是圖像 ‘.img ',另一個是圖像頭文件 '.hdr',該文件記錄了圖像的信息,如圖像尺寸、波段數、數據類型和大小端等。如果缺少頭文件,將無法對圖像進行讀取,因此頭文件十分重要。

2、讀取

使用Matlab中NifTi包讀取。

eg:

img=load_nii(‘D:\a01_101_bmask.hdr')

如何將.img/.hdr格式轉.nii格式

看完了這篇文章,相信你對如何將.img/.hdr格式轉.nii格式有了一定的了解,想了解更多相關知識,歡迎關注億速云行業資訊頻道,感謝各位的閱讀!

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