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這篇文章主要介紹“怎么用R語言繪制Bubble Matrix氣泡矩陣圖”的相關知識，小編通過實際案例向大家展示操作過程，操作方法簡單快捷，實用性強，希望這篇“怎么用R語言繪制Bubble Matrix氣泡矩陣圖”文章能幫助大家解決問題。
對于氣泡矩陣圖，小仙有同樣的困惑。研究了一下，也只能理解個大概，暫且認為就是坐標軸相同的兩種數據集可以用一張氣泡矩陣圖來展示，氣泡的大小和顏色可呈現兩種不同的信息。
首先要把你想要繪圖的數據調整成R語言可以識別的格式，建議大家在excel中保存成csv格式。
data<-read.csv(“your file path”, header = T) #注釋：header=T表示數據中的第一行是列名，如果沒有列名就用header=F
library(reshape2) library(ggplot2) #注釋：package使用之前需要調用
data_melt<-melt (data)
names(data_melt) = c('Gene', 'Cell', 'Value')
#注釋：melt()函數把表格中的寬數據變成長數據
p<-ggplot(data_melt, aes(x = Gene, y = Cell, size = Value, color=Cell)) + geom_point()
p<-ggplot(data_melt, aes(x = Gene, y = Cell, size = Value, color=Cell)) + geom_point()+ theme(panel.background = element_blank(), panel.grid.major = element_line(colour = "gray"), panel.border = element_rect(colour="black",fill=NA))
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