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小編給大家分享一下bioperl如何直接讀取輸出gz壓縮格式的fasta序列，相信大部分人都還不怎么了解，因此分享這篇文章給大家參考一下，希望大家閱讀完這篇文章后大有收獲，下面讓我們一起去了解一下吧！
bioperl 直接讀取輸出gz壓縮格式的fasta序列，代碼示例：
die "perl $0 <id><fa><OUT>" unless(@ARGV==3); use Math::BigFloat; use Bio::SeqIO; use Bio::Seq; use Data::Dumper; use PerlIO::gzip; open $FI, "<:gzip", "$ARGV[1]" or die "$!"; open $FO, ">:gzip", "$ARGV[2]" or die "$!"; $in = Bio::SeqIO->new(-fh => $FI , -format => 'Fasta'); $out = Bio::SeqIO->new(-fh => $FO , -format => 'Fasta');
另一種寫法也是可以的：
use Bio::SeqIO; use Bio::Seq; use Data::Dumper; use PerlIO::gzip; open FI, "<:gzip", "$ARGV[1]" or die "$!"; open FO, ">:gzip", "$ARGV[2]" or die "$!"; $in = Bio::SeqIO->new(-fh => \*FI , -format => 'Fasta'); $out = Bio::SeqIO->new(-fh => \*FO , -format => 'Fasta');
以上是“bioperl如何直接讀取輸出gz壓縮格式的fasta序列”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！相信大家都有了一定的了解，希望分享的內容對大家有所幫助，如果還想學習更多知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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