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這篇文章主要介紹bioperl如何讀寫fasta/fastq壓縮文件，文中介紹的非常詳細，具有一定的參考價值，感興趣的小伙伴們一定要看完！
bioperl讀寫fasta/fastq壓縮文件
bioperl讀寫gz壓縮格式的fasta/fastq文件方法如下：
輸入文件句柄：
fastq文件
open my $FQ ,"zcat infile.fq.gz|" or die "$!";
my$fq=Bio::SeqIO->new(-fh=>$FQ,-format=>'fastq');
fasta文件
open my $FA ,"zcat infile.fa.gz|" or die "$!";
my$fa=Bio::SeqIO->new(-fh=>$FA,-format=>'fasta');
輸出文件句柄：
fastq文件
open my $GZ ,"| gzip >outfile.fq.gz" or die $!;
my$out = Bio::SeqIO->new(-fh => $GZ , -format => 'fastq');
fasta文件
open my $GZ ,"| gzip >outfile.fa.gz" or die $!;
my$out = Bio::SeqIO->new(-fh => $GZ , -format => 'fasta');
以上是“bioperl如何讀寫fasta/fastq壓縮文件”這篇文章的所有內容，感謝各位的閱讀！希望分享的內容對大家有幫助，更多相關知識，歡迎關注億速云行業資訊頻道！
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