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如何在R語言中使用Fisher進行判斷?針對這個問題,這篇文章詳細介紹了相對應的分析和解答,希望可以幫助更多想解決這個問題的小伙伴找到更簡單易行的方法。
1. 判別分析與Fisher判別
不嚴謹但是通俗的說法,判別分析(Discriminant Analysis)是一種多元(多個變量)統計分析方法,它根據樣本的多個已知變量的值對樣本進行分類的方法。一般來說,判別分析由兩個階段構成——學習(訓練)和判別。在學習階段,給定一批已經被分類好的樣本,根據它們的分類情況和樣本的多個變量的值來學習(訓練)得到一種判別方法;在判別階段用前一階段得到的判別方法對其他樣本進行判別。
Fisher判別(Fisher Discrimination Method)又被稱為線性判別(LDA,Linear Discriminative Analysis),是判別分析的一種,歷史可以追溯到1936年。它的核心思想是將多維數據(多個變量)投影(使用線性運算)到一維(單一變量)上,然后通過給定閾值將樣本根據投影后的單一變量進行分類。
Fisher判別的學習(訓練)階段,就是找到合適的投影方式,使得對于已經被分類好的樣本,同一類的樣本被投影后盡量扎堆。學習階段的結果是找到一系列的系數(Coeffcient),構成形如
y=a1 * x1 + a2 * x2 + a3 * x3 + ... + an * xn 其中:a1,a2,... an是系數,x1,x2,... ,xn是變量值。
的判別式和閾值。而判別階段可以根據這個判別式計算出y,并根據閾值將樣本進行分類。
2. 在R中使用Fisher判別
R中使用Fisher判別說起來很簡單,但是我當初也放狗搜索了不短的時間才搞明白如何使用。
首先,它在R里不叫Fisher,用Fisher搜索多半誤入歧途。在R中,它叫LDA(Linear Discriminative Analysis)。
其次,它存在于一個叫MASS的包里。在Ubuntu 13.10中使用:
sudo apt-get install r-base
這樣安裝以后默認就有,然后使用下面語句引用這個包:
> library(MASS)
再次,引用了MASS包以后就可以使用lda命令了:
> params <- lda(y~x1+x2+x3, data=d)
其中,第一個參數是判別式的形式,第二個參數是用來訓練的樣本數據。lda命令執行后,會輸出構成判別式的各個系數。
最后,使用predict命令對未分類的樣本進行判別。
> predict(params, newdata)
其中,第一個參數是上一階段lda命令的結果,第二個參數是用來分類的樣本數據。自此,整個fisher判別過程完成。
3. 實例
3.1 數據
準備好兩個csv文件,用來訓練的已分類數據叫learn.csv,用來判別的未分類數據叫infer.csv。learn.csv共有六列構成,其第一行分別為Band1,Band2,Band3,Band4, Band5, Class,分別代表變量1、變量2、變量3和類別。infer.csv由六列構成:Band1, Band2, Band3, Band4, Band5。同樣第一列包含列名。csv文件的字段間都用逗號分隔。
3.2 操作步驟
1. 讀取learn.csv
> d <- read.csv("~/data/learn.csv") > d2 <- read.csv("~/data/infer.csv")
2. 訓練
> lda(Class ~ Band1+Band2+Band3+Band4+Band5, data=d)
訓練結果:
> params Call: lda(Class ~ Band1 + Band2 + Band3 + Band4 + Band5, data = data) Prior probabilities of groups: 0 1 0.4220068 0.5779932 Group means: Band1 Band2 Band3 Band4 Band5 0 318.3189 0.0000000 0.0000000 0.00000 0.00000 1 322.1881 -0.7703634 -0.2642972 33.92608 36.39715 Coefficients of linear discriminants: LD1 Band1 0.02173212 Band2 -0.08647688 Band3 -0.01199366 Band4 0.10619769 Band5 0.10560976
3. 判別
> ret <- predict(params, d2)
輸出結果:
> write.csv(d2, file="~/data/output.csv"
關于如何在R語言中使用Fisher進行判斷問題的解答就分享到這里了,希望以上內容可以對大家有一定的幫助,如果你還有很多疑惑沒有解開,可以關注億速云行業資訊頻道了解更多相關知識。
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