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怎么使用Pytorch+PyG實現GCN

發布時間:2023-04-21 17:08:19 來源:億速云 閱讀:159 作者:iii 欄目:開發技術

這篇“怎么使用Pytorch+PyG實現GCN”文章的知識點大部分人都不太理解,所以小編給大家總結了以下內容,內容詳細,步驟清晰,具有一定的借鑒價值,希望大家閱讀完這篇文章能有所收獲,下面我們一起來看看這篇“怎么使用Pytorch+PyG實現GCN”文章吧。

一、模型結構

在圖神經網絡的研究中,GCN(Graph Convolutional Networks)是一種比較常見且有效的模型。

在GCN模型中,每個節點都包含了該節點鄰居節點信息的聚合,這意味著它是一個全局性模型。一個典型的GCN模型通常由兩部分組成:一個基于消息傳遞算法的卷積層以及一個多層感知器。其中,前者主要完成特征融合,后者負責分類任務。

對于一個具有n個節點的圖G,其特征矩陣X可以表示為:

怎么使用Pytorch+PyG實現GCN

步驟如下:

  • 構建一個兩層的卷積網絡:第一層是GCN層,后面跟著ReLU激活和一個隨機失活層;第二層是輸出分類器。

  • 模型在訓練期間根據具體的損失函數(如交叉熵損失)進行優化,并用于預測新數據。

二、PyTorch實現

PyTorch使用dgl庫可以方便地構建圖,PyG也提供了類似的工具。接下來看一下如何使用PyTorch + PyG實現一個簡單的GCN模型,以Cora數據集為例。

準備數據

Cora是一個分類任務的數據集,其中包含2708個文本節點名稱,以及每個節點的1433維特征(詞匯相關性)。首先,我們需要在PyG中將其轉換為一個帶有相應邊緣信息的圖形對象。具體而言,使用pyg.data.dataset工具加載Cora數據集,然后將其轉換為一個PyG圖。

from torch_geometric.datasets import Planetoid
import torch_geometric.transforms as T
dataset = Planetoid(root='/path/to/dataset', name='Cora', transform=T.NormalizeFeatures())
data = dataset[0]
print(data)

定義GCN模型

在定義PyG的GCN網絡之前,需要定義Convolutional Layer,這個層以鄰接矩陣A作為輸入,通過權重權值矩陣W來散播消息,并輸出一個新特征向量。

import torch.nn.functional as F
from torch_geometric.nn import GCNConv
class Net(torch.nn.Module):
    def __init__(self):
        super(Net, self).__init__()
        self.conv1 = GCNConv(dataset.num_features, 16)
        self.conv2 = GCNConv(16, dataset.num_classes)
    def forward(self, x, edge_index):
        x = self.conv1(x, edge_index)
        x = F.relu(x)
        x = F.dropout(x, training=self.training)
        x = self.conv2(x, edge_index)
        return F.log_softmax(x, dim=1)

定義訓練過程

訓練具體流程如下:

  • 對于每個epoch,進行隨機梯度下降優化。我們選擇交叉熵作為損失函數,并使用Adam作為優化器。

  • 在測試期間,用驗證集對精確度進行評估。

device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu')
model = Net().to(device)
data.to(device)
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01, weight_decay=5e-4)
def train():
    model.train()
    optimizer.zero_grad()
    out = model(data.x, data.edge_index)
    loss = F.nll_loss(out[data.train_mask], data.y[data.train_mask])
    loss.backward()
    optimizer.step()
def test():
    model.eval()
    _, pred = model(data.x, data.edge_index).max(dim=1)
    correct = int(pred[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item())
    acc = correct / int(data.test_mask.sum())
    return acc
for epoch in range(1, 201):
    train()
    test_acc = test()
    print(f'Epoch: {epoch:03d}, Test Acc: {test_acc:.4f}')

以上就是關于“怎么使用Pytorch+PyG實現GCN”這篇文章的內容,相信大家都有了一定的了解,希望小編分享的內容對大家有幫助,若想了解更多相關的知識內容,請關注億速云行業資訊頻道。

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