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這篇文章將為大家詳細講解有關如何使用Perl腳本得到反向互補序列,小編覺得挺實用的,因此分享給大家做個參考,希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。
Perl腳本求得反向互補序列函數如下:
sub reverse_complement_IUPAC { my $dna = shift; # reverse the DNA sequence my $revcomp = reverse($dna); # complement the reversed DNA sequence $revcomp =~ tr/ABCDGHMNRSTUVWXYabcdghmnrstuvwxy/TVGHCDKNYSAABWXRtvghcdknysaabwxr/; return $revcomp; } sub reverse_complement { my $dna = shift; # reverse the DNA sequence my $revcomp = reverse($dna); # complement the reversed DNA sequence $revcomp =~ tr/ACGTacgt/TGCAtgca/; return $revcomp; }
用法,以reverse_complement 為例:
$str = &reverse_complement($a);
#$a變量里存放序列字符串,$str為求得的反向互補序列。
關于“如何使用Perl腳本得到反向互補序列”這篇文章就分享到這里了,希望以上內容可以對大家有一定的幫助,使各位可以學到更多知識,如果覺得文章不錯,請把它分享出去讓更多的人看到。
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