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R語言怎么處理大數據時內存out of memory的問題

發布時間:2022-03-05 15:02:35 來源:億速云 閱讀:1524 作者:iii 欄目:開發技術

這篇文章主要介紹“R語言怎么處理大數據時內存out of memory的問題”,在日常操作中,相信很多人在R語言怎么處理大數據時內存out of memory的問題問題上存在疑惑,小編查閱了各式資料,整理出簡單好用的操作方法,希望對大家解答”R語言怎么處理大數據時內存out of memory的問題”的疑惑有所幫助!接下來,請跟著小編一起來學習吧!

R處理大數據時偶爾會出現out of memory的問題,相關解決方法:

1、memory.size()查看當前work space內存使用狀況(MB)

2、memory.limit()查看當前work space運行使用內存的上限

> memory.size()
[1] 94.2
> memory.limit()
[1] 8081

3、ls() 查看當前work space的變量

4、利用object.size()查看前一步返回結果中涉及的變量所占內存

> ls()
 [1] "aa"          "age"         "bb"          "diabetes"    "expression"  "geneID"      "n"           "patientData"
 [9] "patientID"   "sample1"     "sample2"     "sample3"     "status"     
> object.size(geneID)
88 bytes

5、rm()刪除一些不需要的變量(使用gc()進行Garbage collection

> rm(geneID)
> rm(patientData)
> rm(patientID)
> rm(age)
> gc()
          used (Mb) gc trigger (Mb) max used (Mb)
Ncells  999611 53.4    1770749 94.6  1442291 77.1
Vcells 1996363 15.3    3142662 24.0  2550980 19.5

6、memory.limit(Limit),如果提高內存使用上限

> memory.limit(100000)
[1] 1e+05
> memory.limit()
[1] 1e+05
>

到此,關于“R語言怎么處理大數據時內存out of memory的問題”的學習就結束了,希望能夠解決大家的疑惑。理論與實踐的搭配能更好的幫助大家學習,快去試試吧!若想繼續學習更多相關知識,請繼續關注億速云網站,小編會繼續努力為大家帶來更多實用的文章!

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