溫馨提示×
您好，登錄后才能下訂單哦！
點擊 登錄注冊 即表示同意《億速云用戶服務條款》
您好，登錄后才能下訂單哦！
這篇文章給大家分享的是有關affymetrix芯片未標準化數據分布的示例分析的內容。小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，一起跟隨小編過來看看吧。
獲取芯片原始數據得到為標準化的數據，需要查看原數據的分布情況，可以通過多種方法獲得分布圖片。
以affy包ReadyAffy()讀取CEL結果：AffyBatch對象為例（GSE66196）
1、箱線圖：基于boxplot查看，在加載affy之后，利用boxplot可以直接對AffyBatchd
n.sample = length(AffyBatch$sample) cols = rainbow(n.sample) par(cex = 0.7) if(n.sample>40) par(cex = 0.5) boxplot(AffyBatch,col = cols, las = 2)
2、hist曲線，繪圖類似boxplot，加載affy之后，可以直接進行繪圖
> SampleNames [1] "GSM1616746" "GSM1616747" "GSM1616748" "GSM1616749" "GSM1616750" [6] "GSM1616751" "GSM1616752" "GSM1616753" "GSM1616754" "GSM1616755" [11] "GSM1616756" "GSM1616757"
par(cex=0.7)
if(n.sample>40) par(cex = 0.5)
hist(AffyBatch,col = cols, las = 1,lty=1)
legend("topright",legend =SampleNames,col=cols,lty=1,box.lty=0,bg=NA)感謝各位的閱讀！關于“affymetrix芯片未標準化數據分布的示例分析”這篇文章就分享到這里了，希望以上內容可以對大家有一定的幫助，讓大家可以學到更多知識，如果覺得文章不錯，可以把它分享出去讓更多的人看到吧！
免責聲明：本站發布的內容（圖片、視頻和文字）以原創、轉載和分享為主，文章觀點不代表本網站立場，如果涉及侵權請聯系站長郵箱：is@yisu.com進行舉報，并提供相關證據，一經查實，將立刻刪除涉嫌侵權內容。
