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腫瘤的免疫療法是即手術,放療,化療等傳統治療手段之后興起的一種新型的治療手段,以PD-1/PD-L1抗體為代表的免疫檢查點抑制劑在黑色素瘤,非小細胞肺癌等實體瘤的臨床治療中取得了不錯的進展。
然而該療法也存在響應率低的問題,只有10-30%的腫瘤患者可以從該療法中獲益,為了精確篩選出免疫療法的目標群體,科學家先后嘗試了多種marker。
最直接的想法是將腫瘤組織中PD-L1的表達水平作為marker, 應用免疫組織化學法檢驗患者腫瘤組織PD-L1的表達情況,如果高表達,則說明該患者有可能從免疫療法中獲益。然而這里表達水平的高低并沒有明確的閾值來區分,而且臨床研究發現,低表達或者不表達PD-L1的患者也能從抗PD-L1治療中獲益,這說明PD-L1的表達水平作為marker,其可靠性有待商榷。
腫瘤突變負荷 tumor mutation burden, 簡稱TMB,代表蛋白編碼區的非同義突變分布的密度,用蛋白編碼區的非同義突變位點總數除以蛋白編碼區的總長度, 單位為mutations/mb。
腫瘤的發生是體細胞突變引起的,體細胞在致癌因子的作用下發生基因突變,部分突變細胞經過DNA自我修飾恢復正常,一部分細胞死亡,還有部分突變細胞在其表面表達出新的抗原。正常情況下下,機體的免疫系統可以識別這些抗原,然后通過免疫應答反應來清楚這些突變的細胞,但是腫瘤細胞可以通過抗原的異常表達或者腫瘤微環境的調節,來實現免疫逃逸,繼續分裂生長,形成腫瘤。
TMB的概念中只針對了蛋白編碼區的非同義突變,因為只有這些突變才有可能使得腫瘤細胞產生新抗原。TMB越高,腫瘤細胞產生的新抗原的種類和數量越多,被免疫系統識別的概率越高, 免疫檢查點抑制劑激活機體自身的抗腫瘤免疫應答反應后,殺傷這些腫瘤細胞的概率越大。將TMB劃分為以下3個層級
low TMB : 1-5 mutations/mb
intermediate TMB : 6-19 mutations/mb
high TMB : > 20 mutations/mb
已經有大量文獻報導發現TMB的水平與PD1/PD-L1抗體療效有關,具有較高TMB的腫瘤細胞更易被免疫系統識別,免疫療法對該患者有效的概率也更高。計算腫瘤患者的TMB分值,能夠更好的指導臨床治療。
從TMB的定義可以看出,最直接有效的計算TMB的方法就是全外顯子測序,然而考慮到實驗周期和成本,也有根據靶向熱點基因設計的各種panel,該方法成本低,周期快,然而得到的TMB分值沒有WES準確。
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