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LncCeRbase數據庫怎么用

發布時間:2022-01-17 09:49:00 來源:億速云 閱讀:168 作者:小新 欄目:大數據

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lncRNA可以作為miRNA sponge與miRNA發生相互作用,通過競爭性的結合miRNA, 可以調控其他基因的表達量, 發揮ceRNA的調控功能。

隨著ceRNA研究的不斷進展,相關文獻越來越多,LncCeRbase數據庫收集整理已發表文獻中人類相關的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA信息,網址如下

http://lnccerbase.it1004.com/front/

該數據庫將ceRNA相關信息拆分成了以下4種類別

  1. MiRNA

  2. LncRNA

  3. Gene

  4. Disease


根據任意一種類別,都可以得到相關的ceRNA信息,示意如下

LncCeRbase數據庫怎么用

對于LncRNA, 提供了RNAcentral數據庫的鏈接;對于miRNA, 提供了mirBase數據庫的鏈接;對于Gene,提供了NCBI數據庫的鏈接。

對于ceRNA,給出了文獻的標題,對應的疾病或者組織,發表期刊,pubmed Id。

通過這個數據庫,我們可以得到lncRNA相關的ceRNA信息,既可以作為前期研究的一個調研,也可以通過別人發表的ceRNA文獻,參考其中分析ceRNA的思路和策略。

以上是“LncCeRbase數據庫怎么用”這篇文章的所有內容,感謝各位的閱讀!相信大家都有了一定的了解,希望分享的內容對大家有所幫助,如果還想學習更多知識,歡迎關注億速云行業資訊頻道!

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