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lncRNA可以作為miRNA sponge與miRNA發生相互作用,通過競爭性的結合miRNA, 可以調控其他基因的表達量, 發揮ceRNA的調控功能。
隨著ceRNA研究的不斷進展,相關文獻越來越多,LncCeRbase數據庫收集整理已發表文獻中人類相關的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA信息,網址如下
http://lnccerbase.it1004.com/front/
該數據庫將ceRNA相關信息拆分成了以下4種類別
MiRNA
LncRNA
Gene
Disease
根據任意一種類別,都可以得到相關的ceRNA信息,示意如下
對于LncRNA
, 提供了RNAcentral
數據庫的鏈接;對于miRNA
, 提供了mirBase
數據庫的鏈接;對于Gene
,提供了NCBI
數據庫的鏈接。
對于ceRNA
,給出了文獻的標題,對應的疾病或者組織,發表期刊,pubmed Id。
通過這個數據庫,我們可以得到lncRNA相關的ceRNA信息,既可以作為前期研究的一個調研,也可以通過別人發表的ceRNA文獻,參考其中分析ceRNA的思路和策略。
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