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本篇內容介紹了“bcftools的安裝教程”的有關知識，在實際案例的操作過程中，不少人都會遇到這樣的困境，接下來就讓小編帶領大家學習一下如何處理這些情況吧！希望大家仔細閱讀，能夠學有所成！
bcftools 是samtools 的開發者提供的一款專門操作VCF文件的工具，它可以處理VCF格式，也可以處理VCF對應的二進制文件。
github的地址如下
https://github.com/samtools/bcftools
安裝過程如下
wget https://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.8/bcftools-1.8.tar.bz2 tar xjvf bcftools-1.8.tar.bz2 cd bcftools-1.8/ ./configure make
解壓縮之后，編譯即可。
和samtools , bcftools 由很多的子命令構成，所有的子命令可以分成以下3大類別
bcftools 也可以分析SNP,CNV 等基因組變異，涉及到的子命令如下
call
consensus
cnv
csq
filter
gtcheck
mpileup
roh
stats
包括對VCF文件進行格式轉換，過濾，排序，取交集等功能，涉及到的子命令如下
annotate
concat
convert
isec
merge
norm
plugin
query
reheader
sort
view
對應的子命令為index
bcftools 是C語言開發的，所以處理速度非常快，可以看做是VCFtools 的升級版本。
bcftools 在處理文件時，還可以識別bgzip壓縮之后的VCF文件。在后續文章中，會對bcftools的用法進行詳細介紹。
“bcftools的安裝教程”的內容就介紹到這里了，感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業相關的知識可以關注億速云網站，小編將為大家輸出更多高質量的實用文章！
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