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詳解Tensorflow數據讀取有三種方式(next_batch)

發布時間:2020-09-15 20:46:03 來源:腳本之家 閱讀:231 作者:Dean0Winchester 欄目:開發技術

Tensorflow數據讀取有三種方式:

  1. Preloaded data: 預加載數據
  2. Feeding: Python產生數據,再把數據喂給后端。
  3. Reading from file: 從文件中直接讀取

這三種有讀取方式有什么區別呢? 我們首先要知道TensorFlow(TF)是怎么樣工作的。

TF的核心是用C++寫的,這樣的好處是運行快,缺點是調用不靈活。而Python恰好相反,所以結合兩種語言的優勢。涉及計算的核心算子和運行框架是用C++寫的,并提供API給Python。Python調用這些API,設計訓練模型(Graph),再將設計好的Graph給后端去執行。簡而言之,Python的角色是Design,C++是Run。

一、預加載數據:

import tensorflow as tf 
# 設計Graph 
x1 = tf.constant([2, 3, 4]) 
x2 = tf.constant([4, 0, 1]) 
y = tf.add(x1, x2) 
# 打開一個session --> 計算y 
with tf.Session() as sess: 
  print sess.run(y) 

二、python產生數據,再將數據喂給后端

import tensorflow as tf 
# 設計Graph 
x1 = tf.placeholder(tf.int16) 
x2 = tf.placeholder(tf.int16) 
y = tf.add(x1, x2) 
# 用Python產生數據 
li1 = [2, 3, 4] 
li2 = [4, 0, 1] 
# 打開一個session --> 喂數據 --> 計算y 
with tf.Session() as sess: 
  print sess.run(y, feed_dict={x1: li1, x2: li2}) 

說明:在這里x1, x2只是占位符,沒有具體的值,那么運行的時候去哪取值呢?這時候就要用到sess.run()中的feed_dict參數,將Python產生的數據喂給后端,并計算y。

這兩種方案的缺點:

1、預加載:將數據直接內嵌到Graph中,再把Graph傳入Session中運行。當數據量比較大時,Graph的傳輸會遇到效率問題。

2、用占位符替代數據,待運行的時候填充數據。

前兩種方法很方便,但是遇到大型數據的時候就會很吃力,即使是Feeding,中間環節的增加也是不小的開銷,比如數據類型轉換等等。最優的方案就是在Graph定義好文件讀取的方法,讓TF自己去從文件中讀取數據,并解碼成可使用的樣本集。

三、從文件中讀取,簡單來說就是將數據讀取模塊的圖搭好

詳解Tensorflow數據讀取有三種方式(next_batch)

1、準備數據,構造三個文件,A.csv,B.csv,C.csv

$ echo -e "Alpha1,A1\nAlpha2,A2\nAlpha3,A3" > A.csv 
$ echo -e "Bee1,B1\nBee2,B2\nBee3,B3" > B.csv 
$ echo -e "Sea1,C1\nSea2,C2\nSea3,C3" > C.csv 

2、單個Reader,單個樣本

#-*- coding:utf-8 -*- 
import tensorflow as tf 
# 生成一個先入先出隊列和一個QueueRunner,生成文件名隊列 
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv'] 
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False) 
# 定義Reader 
reader = tf.TextLineReader() 
key, value = reader.read(filename_queue) 
# 定義Decoder 
example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']]) 
#example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([example,label], batch_size=1, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2) 
# 運行Graph 
with tf.Session() as sess: 
  coord = tf.train.Coordinator() #創建一個協調器,管理線程 
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) #啟動QueueRunner, 此時文件名隊列已經進隊。 
  for i in range(10): 
    print example.eval(),label.eval() 
  coord.request_stop() 
  coord.join(threads) 

說明:這里沒有使用tf.train.shuffle_batch,會導致生成的樣本和label之間對應不上,亂序了。生成結果如下:

Alpha1 A2
Alpha3 B1
Bee2 B3
Sea1 C2
Sea3 A1
Alpha2 A3
Bee1 B2
Bee3 C1
Sea2 C3
Alpha1 A2

解決方案:用tf.train.shuffle_batch,那么生成的結果就能夠對應上。

#-*- coding:utf-8 -*- 
import tensorflow as tf 
# 生成一個先入先出隊列和一個QueueRunner,生成文件名隊列 
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv'] 
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False) 
# 定義Reader 
reader = tf.TextLineReader() 
key, value = reader.read(filename_queue) 
# 定義Decoder 
example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']]) 
example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([example,label], batch_size=1, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2) 
# 運行Graph 
with tf.Session() as sess: 
  coord = tf.train.Coordinator() #創建一個協調器,管理線程 
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) #啟動QueueRunner, 此時文件名隊列已經進隊。 
  for i in range(10): 
    e_val,l_val = sess.run([example_batch, label_batch]) 
    print e_val,l_val 
  coord.request_stop() 
  coord.join(threads) 

3、單個Reader,多個樣本,主要也是通過tf.train.shuffle_batch來實現

#-*- coding:utf-8 -*- 
import tensorflow as tf 
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv'] 
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False) 
reader = tf.TextLineReader() 
key, value = reader.read(filename_queue) 
example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']]) 
# 使用tf.train.batch()會多加了一個樣本隊列和一個QueueRunner。 
#Decoder解后數據會進入這個隊列,再批量出隊。 
# 雖然這里只有一個Reader,但可以設置多線程,相應增加線程數會提高讀取速度,但并不是線程越多越好。 
example_batch, label_batch = tf.train.batch( 
   [example, label], batch_size=5) 
with tf.Session() as sess: 
  coord = tf.train.Coordinator() 
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) 
  for i in range(10): 
    e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch]) 
    print e_val,l_val 
  coord.request_stop() 
  coord.join(threads) 

說明:下面這種寫法,提取出來的batch_size個樣本,特征和label之間也是不同步的

#-*- coding:utf-8 -*- 
import tensorflow as tf 
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv'] 
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False) 
reader = tf.TextLineReader() 
key, value = reader.read(filename_queue) 
example, label = tf.decode_csv(value, record_defaults=[['null'], ['null']]) 
# 使用tf.train.batch()會多加了一個樣本隊列和一個QueueRunner。 
#Decoder解后數據會進入這個隊列,再批量出隊。 
# 雖然這里只有一個Reader,但可以設置多線程,相應增加線程數會提高讀取速度,但并不是線程越多越好。 
example_batch, label_batch = tf.train.batch( 
   [example, label], batch_size=5) 
with tf.Session() as sess: 
  coord = tf.train.Coordinator() 
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) 
  for i in range(10): 
    print example_batch.eval(), label_batch.eval() 
  coord.request_stop() 
  coord.join(threads) 

說明:輸出結果如下:可以看出feature和label之間是不對應的

['Alpha1' 'Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2'] ['B3' 'C1' 'C2' 'C3' 'A1']
['Alpha2' 'Alpha3' 'Bee1' 'Bee2' 'Bee3'] ['C1' 'C2' 'C3' 'A1' 'A2']
['Alpha3' 'Bee1' 'Bee2' 'Bee3' 'Sea1'] ['C2' 'C3' 'A1' 'A2' 'A3']

4、多個reader,多個樣本

#-*- coding:utf-8 -*- 
import tensorflow as tf 
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv'] 
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False) 
reader = tf.TextLineReader() 
key, value = reader.read(filename_queue) 
record_defaults = [['null'], ['null']] 
#定義了多種解碼器,每個解碼器跟一個reader相連 
example_list = [tf.decode_csv(value, record_defaults=record_defaults) 
         for _ in range(2)] # Reader設置為2 
# 使用tf.train.batch_join(),可以使用多個reader,并行讀取數據。每個Reader使用一個線程。 
example_batch, label_batch = tf.train.batch_join( 
   example_list, batch_size=5) 
with tf.Session() as sess: 
  coord = tf.train.Coordinator() 
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) 
  for i in range(10): 
    e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch]) 
    print e_val,l_val 
  coord.request_stop() 
  coord.join(threads) 

tf.train.batch與tf.train.shuffle_batch函數是單個Reader讀取,但是可以多線程。tf.train.batch_join與tf.train.shuffle_batch_join可設置多Reader讀取,每個Reader使用一個線程。至于兩種方法的效率,單Reader時,2個線程就達到了速度的極限。多Reader時,2個Reader就達到了極限。所以并不是線程越多越快,甚至更多的線程反而會使效率下降。

5、迭代控制,設置epoch參數,指定我們的樣本在訓練的時候只能被用多少輪

#-*- coding:utf-8 -*- 
import tensorflow as tf 
filenames = ['A.csv', 'B.csv', 'C.csv'] 
#num_epoch: 設置迭代數 
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False,num_epochs=3) 
reader = tf.TextLineReader() 
key, value = reader.read(filename_queue) 
record_defaults = [['null'], ['null']] 
#定義了多種解碼器,每個解碼器跟一個reader相連 
example_list = [tf.decode_csv(value, record_defaults=record_defaults) 
         for _ in range(2)] # Reader設置為2 
# 使用tf.train.batch_join(),可以使用多個reader,并行讀取數據。每個Reader使用一個線程。 
example_batch, label_batch = tf.train.batch_join( 
   example_list, batch_size=1) 
#初始化本地變量 
init_local_op = tf.initialize_local_variables() 
with tf.Session() as sess: 
  sess.run(init_local_op) 
  coord = tf.train.Coordinator() 
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) 
  try: 
    while not coord.should_stop(): 
      e_val,l_val = sess.run([example_batch,label_batch]) 
      print e_val,l_val 
  except tf.errors.OutOfRangeError: 
      print('Epochs Complete!') 
  finally: 
      coord.request_stop() 
  coord.join(threads) 
  coord.request_stop() 
  coord.join(threads) 

在迭代控制中,記得添加tf.initialize_local_variables(),官網教程沒有說明,但是如果不初始化,運行就會報錯。

對于傳統的機器學習而言,比方說分類問題,[x1 x2 x3]是feature。對于二分類問題,label經過one-hot編碼之后就會是[0,1]或者[1,0]。一般情況下,我們會考慮將數據組織在csv文件中,一行代表一個sample。然后使用隊列的方式去讀取數據

詳解Tensorflow數據讀取有三種方式(next_batch)

說明:對于該數據,前三列代表的是feature,因為是分類問題,后兩列就是經過one-hot編碼之后得到的label

使用隊列讀取該csv文件的代碼如下:

#-*- coding:utf-8 -*- 
import tensorflow as tf 
# 生成一個先入先出隊列和一個QueueRunner,生成文件名隊列 
filenames = ['A.csv'] 
filename_queue = tf.train.string_input_producer(filenames, shuffle=False) 
# 定義Reader 
reader = tf.TextLineReader() 
key, value = reader.read(filename_queue) 
# 定義Decoder 
record_defaults = [[1], [1], [1], [1], [1]] 
col1, col2, col3, col4, col5 = tf.decode_csv(value,record_defaults=record_defaults) 
features = tf.pack([col1, col2, col3]) 
label = tf.pack([col4,col5]) 
example_batch, label_batch = tf.train.shuffle_batch([features,label], batch_size=2, capacity=200, min_after_dequeue=100, num_threads=2) 
# 運行Graph 
with tf.Session() as sess: 
  coord = tf.train.Coordinator() #創建一個協調器,管理線程 
  threads = tf.train.start_queue_runners(coord=coord) #啟動QueueRunner, 此時文件名隊列已經進隊。 
  for i in range(10): 
    e_val,l_val = sess.run([example_batch, label_batch]) 
    print e_val,l_val 
  coord.request_stop() 
  coord.join(threads) 

輸出結果如下:

詳解Tensorflow數據讀取有三種方式(next_batch)

說明:

record_defaults = [[1], [1], [1], [1], [1]]

代表解析的模板,每個樣本有5列,在數據中是默認用‘,'隔開的,然后解析的標準是[1],也即每一列的數值都解析為整型。[1.0]就是解析為浮點,['null']解析為string類型

二、此處給出了幾種不同的next_batch方法,該文章只是做出代碼片段的解釋,以備以后查看:

 def next_batch(self, batch_size, fake_data=False):
  """Return the next `batch_size` examples from this data set."""
  if fake_data:
   fake_image = [1] * 784
   if self.one_hot:
    fake_label = [1] + [0] * 9
   else:
    fake_label = 0
   return [fake_image for _ in xrange(batch_size)], [
     fake_label for _ in xrange(batch_size)
   ]
  start = self._index_in_epoch
  self._index_in_epoch += batch_size
  if self._index_in_epoch > self._num_examples: # epoch中的句子下標是否大于所有語料的個數,如果為True,開始新一輪的遍歷
   # Finished epoch
   self._epochs_completed += 1
   # Shuffle the data
   perm = numpy.arange(self._num_examples) # arange函數用于創建等差數組
   numpy.random.shuffle(perm) # 打亂
   self._images = self._images[perm]
   self._labels = self._labels[perm]
   # Start next epoch
   start = 0
   self._index_in_epoch = batch_size
   assert batch_size <= self._num_examples
  end = self._index_in_epoch
  return self._images[start:end], self._labels[start:end]

 該段代碼摘自mnist.py文件,從代碼第12行start = self._index_in_epoch開始解釋,_index_in_epoch-1是上一次batch個圖片中最后一張圖片的下邊,這次epoch第一張圖片的下標是從 _index_in_epoch開始,最后一張圖片的下標是_index_in_epoch+batch, 如果 _index_in_epoch 大于語料中圖片的個數,表示這個epoch是不合適的,就算是完成了語料的一遍的遍歷,所以應該對圖片洗牌然后開始新一輪的語料組成batch開始

def ptb_iterator(raw_data, batch_size, num_steps):
 """Iterate on the raw PTB data.

 This generates batch_size pointers into the raw PTB data, and allows
 minibatch iteration along these pointers.

 Args:
  raw_data: one of the raw data outputs from ptb_raw_data.
  batch_size: int, the batch size.
  num_steps: int, the number of unrolls.

 Yields:
  Pairs of the batched data, each a matrix of shape [batch_size, num_steps].
  The second element of the tuple is the same data time-shifted to the
  right by one.

 Raises:
  ValueError: if batch_size or num_steps are too high.
 """
 raw_data = np.array(raw_data, dtype=np.int32)

 data_len = len(raw_data)
 batch_len = data_len // batch_size #有多少個batch
 data = np.zeros([batch_size, batch_len], dtype=np.int32) # batch_len 有多少個單詞
 for i in range(batch_size): # batch_size 有多少個batch
  data[i] = raw_data[batch_len * i:batch_len * (i + 1)]

 epoch_size = (batch_len - 1) // num_steps # batch_len 是指一個batch中有多少個句子
 #epoch_size = ((len(data) // model.batch_size) - 1) // model.num_steps # // 表示整數除法
 if epoch_size == 0:
  raise ValueError("epoch_size == 0, decrease batch_size or num_steps")

 for i in range(epoch_size):
  x = data[:, i*num_steps:(i+1)*num_steps]
  y = data[:, i*num_steps+1:(i+1)*num_steps+1]
  yield (x, y)

第三種方式:

  def next(self, batch_size):
    """ Return a batch of data. When dataset end is reached, start over.
    """
    if self.batch_id == len(self.data):
      self.batch_id = 0
    batch_data = (self.data[self.batch_id:min(self.batch_id +
                         batch_size, len(self.data))])
    batch_labels = (self.labels[self.batch_id:min(self.batch_id +
                         batch_size, len(self.data))])
    batch_seqlen = (self.seqlen[self.batch_id:min(self.batch_id +
                         batch_size, len(self.data))])
    self.batch_id = min(self.batch_id + batch_size, len(self.data))
    return batch_data, batch_labels, batch_seqlen

第四種方式:

def batch_iter(sourceData, batch_size, num_epochs, shuffle=True):
  data = np.array(sourceData) # 將sourceData轉換為array存儲
  data_size = len(sourceData)
  num_batches_per_epoch = int(len(sourceData) / batch_size) + 1
  for epoch in range(num_epochs):
    # Shuffle the data at each epoch
    if shuffle:
      shuffle_indices = np.random.permutation(np.arange(data_size))
      shuffled_data = sourceData[shuffle_indices]
    else:
      shuffled_data = sourceData

    for batch_num in range(num_batches_per_epoch):
      start_index = batch_num * batch_size
      end_index = min((batch_num + 1) * batch_size, data_size)

      yield shuffled_data[start_index:end_index]

迭代器的用法,具體學習Python迭代器的用法

另外需要注意的是,前三種方式只是所有語料遍歷一次,而最后一種方法是,所有語料遍歷了num_epochs次

以上就是本文的全部內容,希望對大家的學習有所幫助,也希望大家多多支持億速云。

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