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前言
昨天才開始接觸,鼓搗了一個下午,接下來會持續更新,如果哪里有錯誤的地方,望各位大佬指出,謝謝!
數據描述
兩個文件,一個文件包含了網絡圖的節點,節點存在類別(0,1,2,3)四類,但是0類別舍去,不畫出;另一個文件包含了網絡圖的邊,數據基本特征如下:
圖1中,id表示節點,b是類別;圖2中,兩個數字表示邊連接的兩個點。
Networkx
安裝
我的系統是Mac OS,直接在terminal輸入sudo pip install networkx就可以安裝,由于代碼中涉及幾個函數,在python3中會報錯,我用python2.7.13實現的
基本使用方法
import networkx as nx #導入networkx包 import matplotlib.pyplot as plt #導入繪圖包matplotlib(需要安裝,方法見第一篇筆記) G =nx.random_graphs.barabasi_albert_graph(100,1) #生成一個BA無標度網絡G nx.draw(G) #繪制網絡G plt.savefig("ba.png") #輸出方式1: 將圖像存為一個png格式的圖片文件 plt.show() #輸出方式2: 在窗口中顯示這幅圖像
參數介紹基本
- `node_size`: 指定節點的尺寸大小(默認是300,單位未知,就是上圖中那么大的點)
- `node_color`: 指定節點的顏色 (默認是紅色,可以用字符串簡單標識顏色,例如'r'為紅色,'b'為綠色等,具體可查看手冊)
- `node_shape`: 節點的形狀(默認是圓形,用字符串'o'標識,具體可查看手冊)
- `alpha`: 透明度 (默認是1.0,不透明,0為完全透明)
- `width`: 邊的寬度 (默認為1.0)
- `edge_color`: 邊的顏色(默認為黑色)
- `style`: 邊的樣式(默認為實現,可選: solid|dashed|dotted,dashdot)
- `with_labels`: 節點是否帶標簽(默認為True)
- `font_size`: 節點標簽字體大小 (默認為12)
- `font_color`: 節點標簽字體顏色(默認為黑色)
布局
代碼
# coding:utf-8 import networkx as nx import matplotlib.pyplot as plt import csv with open('node-8.csv','rb') as csvfile: reader = csv.DictReader(csvfile) column = [row['b'] for row in reader] id_tag0 = [row['id'] for row in reader] #print column id_tag = [] for item in id_tag0: id_tag.append(int(item)) # =================Setting node parameters==================== node_0 = [] node_1 = [] node_2 = [] node_3 = [] node_color = [] node_color_y = [] node_color_r = [] node_color_g = [] node_color_b = [] node_shape = [] node_shape_0 = [] node_shape_1 = [] node_shape_2 = [] node_shape_3 = [] for i in range(len(column)): if int(column[i]) == 0: pass elif int(column[i]) == 1: color = 'r' shape = 'o' node_1.append(i) node_color_r.append(color) node_shape_1.append(shape) elif int(column[i]) == 2: color = 'g' shape = 'o' node_2.append(i) node_color_g.append(color) node_shape_2.append(shape) else: color = 'b' shape = '*' node_3.append(i) node_color_b.append(color) node_shape_3.append(shape) node_color.append(color) node_shape.append(shape) # ============================================================== with open('node-8.csv','rb') as csvfile: reader = csv.DictReader(csvfile) column1 = [row['b'] for row in reader] id_tag1 = [row['id'] for row in reader] #print column id_tag11 = [] for item in id_tag1: id_tag11.append(int(item)) edge = [] with open('edge-8.txt','r') as f: data = f.readlines() for line in data: #print line line = tuple(line.replace('\r','').replace('\n','').replace('\t','').split(',')) edge.append(line) #print edge # ===============Setting edge parameters========================= edge_color = [] edge_style = [] for item in edge: #print item if int(column1[int(item[0])]) == 0 or int(column1[int(item[1])]) == 0: pass elif int(column1[int(item[0])]) == 1 or int(column1[int(item[1])]) == 1: color = 'r' #style0 = 'dashdot' #color_r_list.append(color) elif int(column1[int(item[0])]) == 2 or int(column1[int(item[1])]) == 2: color = 'g' #style0 = 'dashed' #color_r_list.append(color) else: color = 'b' #style0 = 'dotted' #color_b_list.append(color) edge_color.append(color) #edge_style.append(style0) G = nx.Graph() #G.add_nodes_from(id_tag) G.add_edges_from(edge) #nx.draw(G,pos=nx.random_layout(G), nodelist = node_0, node_color = node_color_y, node_size=120, node_shape=node_shape_0) #nx.draw(G,pos=nx.random_layout(G), nodelist = node_1, node_color = node_color_r, node_size=120, node_shape=node_shape_1) #nx.draw(G,pos=nx.random_layout(G), nodelist = node_2, node_color = node_color_g, node_size=120, node_shape=node_shape_2) #nx.draw(G,pos=nx.random_layout(G), nodelist = node_3, node_color = node_color_b, node_size=120, node_shape=node_shape_3) nx.draw_networkx(G,pos=nx.random_layout(G),node_color=node_color,node_size=10,node_shape='o',edge_color=edge_color,width=0.3,style='solid',font_size=8) #nx.draw_networkx(G,pos=nx.random_layout(G),nodelist = node_1,node_color=node_color,node_size=100,node_shape='o',style='dashdot') #nx.draw_networkx(G,pos=nx.random_layout(G),node_color=color_g_list,node_size=150,node_shape='^',style='dashed') #nx.draw_networkx(G,pos=nx.random_layout(G),node_color=color_b_list,node_size=150,node_shape='*',style='dotted') #plt.legend() #nx.draw_networkx(G) plt.show()
畫圖
以上就是本文的全部內容,希望對大家的學習有所幫助,也希望大家多多支持億速云。
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