在C#中設置圖標的透明度可以通過設置圖標的Alpha通道來實現。以下是設置圖標透明度的示例代碼：

using System;
using System.Drawing;
using System.Windows.Forms;

namespace SetIconOpacity
{
    public partial class Form1 : Form
    {
        public Form1()
        {
            InitializeComponent();
        }

        private void Form1_Load(object sender, EventArgs e)
        {
            // 讀取圖標文件
            Icon icon = new Icon("icon.ico");

            // 設置透明度為50%
            icon = SetIconOpacity(icon, 0.5f);

            // 將圖標設置為窗體的圖標
            this.Icon = icon;
        }

        private Icon SetIconOpacity(Icon icon, float opacity)
        {
            Bitmap bmp = icon.ToBitmap();
            for (int y = 0; y < bmp.Height; y++)
            {
                for (int x = 0; x < bmp.Width; x++)
                {
                    Color c = bmp.GetPixel(x, y);
                    bmp.SetPixel(x, y, Color.FromArgb((int)(opacity * 255), c.R, c.G, c.B));
                }
            }
            return Icon.FromHandle(bmp.GetHicon());
        }
    }
}

在上面的示例中，我們首先讀取了一個圖標文件并將其設置為窗體的圖標。然后通過SetIconOpacity方法來設置圖標的透明度，該方法會遍歷圖標的每個像素，并根據指定的透明度設置Alpha通道的值。最后將設置好透明度的圖標設置為窗體的圖標。