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怎么使用Pytorch+PyG實現MLP

發布時間:2023-03-08 11:45:35 來源:億速云 閱讀:118 作者:iii 欄目:開發技術

這篇文章主要講解了“怎么使用Pytorch+PyG實現MLP”,文中的講解內容簡單清晰,易于學習與理解,下面請大家跟著小編的思路慢慢深入,一起來研究和學習“怎么使用Pytorch+PyG實現MLP”吧!

項目環境:

  • 平臺:Windows10

  • 語言環境:python3.7

  • 編譯器:PyCharm

  • PyTorch版本:1.11.0

  • PyG版本:2.1.0

一、導入相關庫

本項目我們需要結合兩個庫,一個是Pytorch,因為還需要按照torch的網絡搭建模型進行書寫,第二個是PyG,因為在torch中并沒有關于圖網絡層的定義,所以需要torch_geometric這個庫來定義一些圖層。

import torch
import torch.nn.functional as F
import torch.nn as nn
import torch_geometric.nn as pyg_nn
from torch_geometric.datasets import Planetoid

二、加載Cora數據集

本文使用的數據集是比較經典的Cora數據集,它是一個根據科學論文之間相互引用關系而構建的Graph數據集合,論文分為7類,共2708篇。

  • Genetic_Algorithms

  • Neural_Networks

  • Probabilistic_Methods

  • Reinforcement_Learning

  • Rule_Learning

  • Theory

這個數據集是一個用于圖節點分類的任務,數據集中只有一張圖,這張圖中含有2708個節點,10556條邊,每個節點的特征維度為1433。

# 1.加載Cora數據集
dataset = Planetoid(root='./data/Cora', name='Cora')

三、定義MLP網絡

這里我們就不重點介紹MLP網絡了,相信大家能夠掌握基本原理,本文我們使用的是PyG定義網絡層,在PyG中已經定義好了MLP這個層,該層采用的就是感知機機制。

怎么使用Pytorch+PyG實現MLP

對于MLP的常用參數:

  • channel_list:樣本輸入層、中間層、輸出層維度的列表

  • in_channels:每個樣本的輸入維度,就是每個節點的特征維度

  • hidden_channels:單層神經網絡中間的隱層大小

  • out_channels:經過MLP后映射成的新的維度,就是經過MLP后每個節點的維度長度

  • num_layers:感知機層數

  • dropout:每個隱藏層的丟棄率,如果存在多層可以使用列表傳入

  • act:激活函數,默認為relu

  • bias:訓練一個偏置b

對于本文實現的 pyg_nn.MLP([num_node_features, 32, 64, 128]) 的含義就是定義一個三層的感知機網絡,按照 PyTorch 實現等價于如下代碼:

lin_1 = nn.Linear(num_node_features, 32)
lin_2 = nn.Linear(32, 64)
lin_3 = nn.Linear(64, 128)

對于 PyG 中實現起來較為簡單,以列表方式傳入所以隱層大小即可,第一個維度代表樣本的輸入特征維度,最后一個維度代表輸出的維度大小,中間維度代表隱層的大小,所以 len(channel_list) - 1 代表 MLP 的層數,這種方式是以傳入 channel_list 方式定義模型,還可以按照正常參數方式進行傳遞定義,代碼如下:

pyg_nn.MLP(in_channels=16,
		   hidden_channels=32,
		   out_channels=128,
		   num_layers=3)

網絡定義代碼如下:

# 2.定義MLP網絡
class MLP(nn.Module):
    def __init__(self, num_node_features, num_classes):
        super(MLP, self).__init__()
        self.lin_1 = pyg_nn.MLP([num_node_features, 32, 64, 128])
        self.lin_2 = pyg_nn.MLP([128, 64, 32, num_classes])
        
    def forward(self, data):
        x, edge_index = data.x, data.edge_index
        
        x = self.lin_1(x, edge_index)
        x = F.relu(x)
        x = F.dropout(x, training=self.training)
        x = self.lin_2(x, edge_index)
        
        return F.log_softmax(x, dim=1)

上面網絡我們定義了兩個MLP層,第一層的參數的輸入維度就是初始每個節點的特征維度,輸出維度是128。

第二個層的輸入維度為128,輸出維度為分類個數,因為我們需要對每個節點進行分類,最終加上softmax操作。

四、定義模型

下面就是定義了一些模型需要的參數,像學習率、迭代次數這些超參數,然后是模型的定義以及優化器及損失函數的定義,和pytorch定義網絡是一樣的。

device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') # 設備
epochs = 10 # 學習輪數
lr = 0.003 # 學習率
num_node_features = dataset.num_node_features # 每個節點的特征數
num_classes = dataset.num_classes # 每個節點的類別數
data = dataset[0].to(device) # Cora的一張圖

# 3.定義模型
model = MLP(num_node_features, num_classes).to(device)
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=lr) # 優化器
loss_function = nn.NLLLoss() # 損失函數

五、模型訓練

模型訓練部分也是和pytorch定義網絡一樣,因為都是需要經過前向傳播、反向傳播這些過程,對于損失、精度這些指標可以自己添加。

# 訓練模式
model.train()

for epoch in range(epochs):
    optimizer.zero_grad()
    pred = model(data)
    
    loss = loss_function(pred[data.train_mask], data.y[data.train_mask]) # 損失
    correct_count_train = pred.argmax(axis=1)[data.train_mask].eq(data.y[data.train_mask]).sum().item() # epoch正確分類數目
    acc_train = correct_count_train / data.train_mask.sum().item() # epoch訓練精度
    
    loss.backward()
    optimizer.step()
    
    if epoch % 20 == 0:
        print("【EPOCH: 】%s" % str(epoch + 1))
        print('訓練損失為:{:.4f}'.format(loss.item()), '訓練精度為:{:.4f}'.format(acc_train))

print('【Finished Training!】')

六、模型驗證

下面就是模型驗證階段,在訓練時我們是只使用了訓練集,測試的時候我們使用的是測試集,注意這和傳統網絡測試不太一樣,在圖像分類一些經典任務中,我們是把數據集分成了兩份,分別是訓練集、測試集,但是在Cora這個數據集中并沒有這樣,它區分訓練集還是測試集使用的是掩碼機制,就是定義了一個和節點長度相同緯度的數組,該數組的每個位置為True或者False,標記著是否使用該節點的數據進行訓練。

# 模型驗證
model.eval()
pred = model(data)

# 訓練集(使用了掩碼)
correct_count_train = pred.argmax(axis=1)[data.train_mask].eq(data.y[data.train_mask]).sum().item()
acc_train = correct_count_train / data.train_mask.sum().item()
loss_train = loss_function(pred[data.train_mask], data.y[data.train_mask]).item()

# 測試集
correct_count_test = pred.argmax(axis=1)[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item()
acc_test = correct_count_test / data.test_mask.sum().item()
loss_test = loss_function(pred[data.test_mask], data.y[data.test_mask]).item()

print('Train Accuracy: {:.4f}'.format(acc_train), 'Train Loss: {:.4f}'.format(loss_train))
print('Test  Accuracy: {:.4f}'.format(acc_test), 'Test  Loss: {:.4f}'.format(loss_test))

七、結果

【EPOCH: 】1
訓練損失為:1.9856 訓練精度為:0.1786
【EPOCH: 】21
訓練損失為:1.5419 訓練精度為:0.4643
【EPOCH: 】41
訓練損失為:1.1653 訓練精度為:0.6500
【EPOCH: 】61
訓練損失為:0.8062 訓練精度為:0.8071
【EPOCH: 】81
訓練損失為:0.5322 訓練精度為:0.9286
【EPOCH: 】101
訓練損失為:0.3487 訓練精度為:0.9714
【EPOCH: 】121
訓練損失為:0.2132 訓練精度為:0.9571
【EPOCH: 】141
訓練損失為:0.1043 訓練精度為:0.9929
【EPOCH: 】161
訓練損失為:0.0601 訓練精度為:1.0000
【EPOCH: 】181
訓練損失為:0.0420 訓練精度為:1.0000
【Finished Training!】

>>>Train Accuracy: 1.0000 Train Loss: 0.0092
>>>Test  Accuracy: 0.1800 Test  Loss: 1.9587


訓練集測試集
Accuracy1.00000.1800
Loss0.00921.9587

完整代碼

import torch
import torch.nn.functional as F
import torch.nn as nn
import torch_geometric.nn as pyg_nn
from torch_geometric.datasets import Planetoid

# 1.加載Cora數據集
dataset = Planetoid(root='./data/Cora', name='Cora')

# 2.定義MLP網絡
class MLP(nn.Module):
    def __init__(self, num_node_features, num_classes):
        super(MLP, self).__init__()
        self.lin_1 = pyg_nn.MLP([num_node_features, 32, 64, 128])
        self.lin_2 = pyg_nn.MLP([128, 64, 32, num_classes])
        
    def forward(self, data):
        x, edge_index = data.x, data.edge_index
        
        x = self.lin_1(x, edge_index)
        x = F.relu(x)
        x = F.dropout(x, training=self.training)
        x = self.lin_2(x, edge_index)
        
        return F.log_softmax(x, dim=1)

device = torch.device('cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu') # 設備
epochs = 200 # 學習輪數
lr = 0.0003 # 學習率
num_node_features = dataset.num_node_features # 每個節點的特征數
num_classes = dataset.num_classes # 每個節點的類別數
data = dataset[0].to(device) # Cora的一張圖

# 3.定義模型
model = MLP(num_node_features, num_classes).to(device)
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=lr) # 優化器
loss_function = nn.NLLLoss() # 損失函數

# 訓練模式
model.train()

for epoch in range(epochs):
    optimizer.zero_grad()
    pred = model(data)
    
    loss = loss_function(pred[data.train_mask], data.y[data.train_mask]) # 損失
    correct_count_train = pred.argmax(axis=1)[data.train_mask].eq(data.y[data.train_mask]).sum().item() # epoch正確分類數目
    acc_train = correct_count_train / data.train_mask.sum().item() # epoch訓練精度
    
    loss.backward()
    optimizer.step()
    
    if epoch % 20 == 0:
        print("【EPOCH: 】%s" % str(epoch + 1))
        print('訓練損失為:{:.4f}'.format(loss.item()), '訓練精度為:{:.4f}'.format(acc_train))

print('【Finished Training!】')

# 模型驗證
model.eval()
pred = model(data)

# 訓練集(使用了掩碼)
correct_count_train = pred.argmax(axis=1)[data.train_mask].eq(data.y[data.train_mask]).sum().item()
acc_train = correct_count_train / data.train_mask.sum().item()
loss_train = loss_function(pred[data.train_mask], data.y[data.train_mask]).item()

# 測試集
correct_count_test = pred.argmax(axis=1)[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item()
acc_test = correct_count_test / data.test_mask.sum().item()
loss_test = loss_function(pred[data.test_mask], data.y[data.test_mask]).item()

print('Train Accuracy: {:.4f}'.format(acc_train), 'Train Loss: {:.4f}'.format(loss_train))
print('Test  Accuracy: {:.4f}'.format(acc_test), 'Test  Loss: {:.4f}'.format(loss_test))

感謝各位的閱讀,以上就是“怎么使用Pytorch+PyG實現MLP”的內容了,經過本文的學習后,相信大家對怎么使用Pytorch+PyG實現MLP這一問題有了更深刻的體會,具體使用情況還需要大家實踐驗證。這里是億速云,小編將為大家推送更多相關知識點的文章,歡迎關注!

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