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這篇文章將為大家詳細講解有關GEOquery如何讀取本地表達矩陣壓縮包，小編覺得挺實用的，因此分享給大家做個參考，希望大家閱讀完這篇文章后可以有所收獲。
利用GEOquery包的getGEO()可以進行芯片相關數據的下載，不過，有人反映不少芯片的表達矩陣下載經常出錯，可以通過手動下載的方式將矩陣文件下載到對應的工作路徑中：
矩陣文件的基本命名格式：GSEXXXXX_series_matrix.txt.gz
為了避免手動整理，可以利用getGEO讀取本地本地的矩陣文件，例如（以GSE66597為例）：
workdir = "F:/GEO/20180605/download/GSE66597" #設置工作路徑 setwd(workdir) gset = getGEO(filename="./GSE66597_series_matrix.txt.gz",AnnotGPL=TRUE,destdir=workdir)
可以讀取對應的矩陣文件外，還可以將其相關的平臺注釋信息文件下載到對應的工作目錄（保存目錄設置成工作目錄）。
完成本都讀取之后可以按照常規方法進行數據的提取和整理。
關于“GEOquery如何讀取本地表達矩陣壓縮包”這篇文章就分享到這里了，希望以上內容可以對大家有一定的幫助，使各位可以學到更多知識，如果覺得文章不錯，請把它分享出去讓更多的人看到。
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