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JBrowse安裝配置的步驟

發布時間:2021-07-10 14:32:52 來源:億速云 閱讀:309 作者:chen 欄目:大數據

本篇內容介紹了“JBrowse安裝配置的步驟”的有關知識,在實際案例的操作過程中,不少人都會遇到這樣的困境,接下來就讓小編帶領大家學習一下如何處理這些情況吧!希望大家仔細閱讀,能夠學有所成!


我用的是阿里云服務器Ubuntu系統

按照 JBrowse使用說明:如何安裝JBrowse這篇教程中的步驟進行安裝 用到的命令是

sudo mkdir /var/www/jbrowse
sudo chown `whoami` /var/www/jbrowse
cd /var/www/jbrowse

# unzip it and cd into it
unzip JBrowse-1.16.9.zip
cd JBrowse-1.16.9
# run setup.sh, quick start with example data
./setup.sh
 

這里需要注意的是sudo chown `whoami` /var/www/jbrowse 這行命令里 不是單引號,而是ESC鍵下面那個

./setup.sh這一步會運行好長時間,因為需要安裝好多依賴的perl模塊,這里吐槽一下perl模塊的安裝好麻煩,或者是我自己沒有掌握正確的安裝方法吧!

我的nginx已經安裝好了 在自己的電腦瀏覽器輸入http://123.56.89.209/jbrowse/JBrowse-1.16.9/index.html?data=sample_data/json/volvox

報錯JBrowse安裝配置的步驟

暫時還不知道是什么原因

然后我將 /var/www/html/目錄下的index.nginx-debian.html文件刪除掉了(記得備份),然后將 /var/www//jbrowse/JBrowse-1.16.9/目錄下的所有內容都復制到了/var/www/html/目錄下

cp -R ../jbrowse/JBrowse-1.16.9/* ./
 

然后在自己本地電腦瀏覽器輸入http://123.56.89.209/index.html?data=sample_data/json/volvox

終于看到了結果

JBrowse安裝配置的步驟
image.png


“JBrowse安裝配置的步驟”的內容就介紹到這里了,感謝大家的閱讀。如果想了解更多行業相關的知識可以關注億速云網站,小編將為大家輸出更多高質量的實用文章!

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