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本篇文章為大家展示了GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數據庫,內容簡明扼要并且容易理解,絕對能使你眼前一亮,通過這篇文章的詳細介紹希望你能有所收獲。
GOA全稱Gene Ontology Annotation, 是EMBL-EBI構建的一個GO注釋信息的數據庫。
該數據庫提供了以下3種生物分子的GO注釋信息
來自UniProtKB數據庫的蛋白
來自RNACentral數據庫的RNA
來自Complex數據庫的蛋白復合物
GOA數據庫的注釋信息不僅包括由Gene Ontology委員會的專家們提供的手工注釋,還包括由生物信息軟件注釋得到的GO注釋信息。詳細的來源如下
GOA的注釋信息可以通過QuickGO進行瀏覽,官網上則提供了FTP下載功能,主要包含以下2種文件
提供了UniProtKB數據庫中蛋白對應的GO注釋信息,同時對于常見的物種,還單獨提供了注釋文件。
提供了其他數據庫的ID和GO ID之間的對應關系,列表如下
FTP的地址如下
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa
GOA的注釋信息通過QuickGO進行瀏覽和檢索,通過FTP服務則可以下載對應的原始注釋信息。
上述內容就是GOA中Gene Ontology是怎樣注釋信息數據庫,你們學到知識或技能了嗎?如果還想學到更多技能或者豐富自己的知識儲備,歡迎關注億速云行業資訊頻道。
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