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怎么在python中通過KNN來填充缺失值?相信很多沒有經驗的人對此束手無策,為此本文總結了問題出現的原因和解決方法,通過這篇文章希望你能解決這個問題。
# 加載庫 import numpy as np from fancyimpute import KNN from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.datasets import make_blobs # 創建模擬特征矩陣 features, _ = make_blobs(n_samples = 1000, n_features = 2, random_state = 1) # 標準化特征 scaler = StandardScaler() standardized_features = scaler.fit_transform(features) standardized_features # 制造缺失值 true_value = standardized_features[0,0] standardized_features[0,0] = np.nan standardized_features # 預測 features_knn_imputed = KNN(k=5, verbose=0).fit_transform(standardized_features) # features_knn_imputed = KNN(k=5, verbose=0).complete(standardized_features) features_knn_imputed # #對比真實值和預測值 print("真實值:", true_value) print("預測值:", features_knn_imputed[0,0]) # 加載庫 import numpy as np from fancyimpute import KNN from sklearn.preprocessing import StandardScaler from sklearn.datasets import make_blobs # 創建模擬特征矩陣 features, _ = make_blobs(n_samples = 1000, n_features = 2, random_state = 1) # 標準化特征 scaler = StandardScaler() standardized_features = scaler.fit_transform(features) standardized_features # 制造缺失值 true_value = standardized_features[0,0] standardized_features[0,0] = np.nan standardized_features # 預測 features_knn_imputed = KNN(k=5, verbose=0).fit_transform(standardized_features) # features_knn_imputed = KNN(k=5, verbose=0).complete(standardized_features) features_knn_imputed # #對比真實值和預測值 print("真實值:", true_value) print("預測值:", features_knn_imputed[0,0]) 真實值: 0.8730186113995938 預測值: 1.0955332713113226
補充:scikit-learn中一種便捷可靠的缺失值填充方法:KNNImputer
在數據挖掘工作中,處理樣本中的缺失值是必不可少的一步。其中對于缺失值插補方法的選擇至關重要,因為它會對最后模型擬合的效果產生重要影響。
在2019年底,scikit-learn發布了0.22版本,此次版本除了修復之前的一些bug外,還更新了很多新功能,對于數據挖掘人員來說更加好用了。其中我發現了一個新增的非常好用的缺失值插補方法:KNNImputer。這個基于KNN算法的新方法使得我們現在可以更便捷地處理缺失值,并且與直接用均值、中位數相比更為可靠。利用“近朱者赤”的KNN算法原理,這種插補方法借助其他特征的分布來對目標特征進行缺失值填充。
使用KNNImputer需要從scikit-learn中導入:
from sklearn.impute import KNNImputer
先來一個小例子開開胃,data中第二個樣本存在缺失值。
data = [[2, 4, 8], [3, np.nan, 7], [5, 8, 3], [4, 3, 8]]
KNNImputer中的超參數與KNN算法一樣,n_neighbors為選擇“鄰居”樣本的個數,先試試n_neighbors=1。
imputer = KNNImputer(n_neighbors=1) imputer.fit_transform(data)
可以看到,因為第二個樣本的第一列特征3和第三列特征7,與第一行樣本的第一列特征2和第三列特征8的歐氏距離最近,所以缺失值按照第一個樣本來填充,填充值為4。那么n_neighbors=2呢?
imputer = KNNImputer(n_neighbors=2) imputer.fit_transform(data)
此時根據歐氏距離算出最近相鄰的是第一行樣本與第四行樣本,此時的填充值就是這兩個樣本第二列特征4和3的均值:3.5。
接下來讓我們看一個實際案例,該數據集來自Kaggle皮馬人糖尿病預測的分類賽題,其中有不少缺失值,我們試試用KNNImputer進行插補。
import numpy as np import pandas as pd import pandas_profiling as pp import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as sns sns.set(context="notebook", ) import warnings warnings.filterwarnings('ignore') %matplotlib inline from sklearn.impute import KNNImputer
#Loading the dataset diabetes_data = pd.read_csv('pima-indians-diabetes.csv') diabetes_data.columns = ['Pregnancies', 'Glucose', 'BloodPressure', 'SkinThickness', 'Insulin', 'BMI', 'DiabetesPedigreeFunction', 'Age', 'Outcome'] diabetes_data.head()
在這個數據集中,0值代表的就是缺失值,所以我們需要先將0轉化為nan值然后進行缺失值處理。
diabetes_data_copy = diabetes_data.copy(deep=True) diabetes_data_copy[['Glucose','BloodPressure','SkinThickness','Insulin','BMI']] = diabetes_data_copy[['Glucose','BloodPressure','SkinThickness','Insulin','BMI']].replace(0, np.NaN) print(diabetes_data_copy.isnull().sum())
在本文中,我們嘗試用DiabetesPedigreeFunction與Age,對BloodPressure中的35個缺失值進行KNNImputer插補。
先來看一下缺失值都在哪幾個樣本:
null_index = diabetes_data_copy.loc[diabetes_data_copy['BloodPressure'].isnull(), :].index null_index
imputer = KNNImputer(n_neighbors=10) diabetes_data_copy[['BloodPressure', 'DiabetesPedigreeFunction', 'Age']] = imputer.fit_transform(diabetes_data_copy[['BloodPressure', 'DiabetesPedigreeFunction', 'Age']]) print(diabetes_data_copy.isnull().sum())
可以看到現在BloodPressure中的35個缺失值消失了。我們看看具體填充后的數據(只截圖了部分):
diabetes_data_copy.iloc[null_index]
1、云計算,典型應用OpenStack。2、WEB前端開發,眾多大型網站均為Python開發。3.人工智能應用,基于大數據分析和深度學習而發展出來的人工智能本質上已經無法離開python。4、系統運維工程項目,自動化運維的標配就是python+Django/flask。5、金融理財分析,量化交易,金融分析。6、大數據分析。
看完上述內容,你們掌握怎么在python中通過KNN來填充缺失值的方法了嗎?如果還想學到更多技能或想了解更多相關內容,歡迎關注億速云行業資訊頻道,感謝各位的閱讀!
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