在日本租用服務器搭建網站的數據庫可以通過以下步驟進行：
1. 選擇一個可靠的日本服務器租用服務提供商。
2. 注冊一個賬戶并選擇日本地區作為服務器的部署地點。
3. 選擇合適的服務器規格和操作系統，一般推薦選擇Linux操作系統。
4. 安裝數據庫管理系統，比如MySQL、PostgreSQL等，并進行配置。
5. 配置數據庫的安全性，包括設置密碼、限制訪問權限等。
6. 在網站的代碼中配置連接數據庫的相關信息，確保網站能夠正確訪問數據庫。
7. 進行測試，確保網站能夠正常訪問數據庫并實現數據交互。
8. 定期備份數據庫，保障數據的安全性和可靠性。
請注意，在搭建網站數據庫時，需要考慮到數據的安全性、性能和可靠性等因素，可以根據具體需求選擇合適的服務器和數據庫管理系統進行配置和優化。
