要在Tomcat中運行PHP腳本，可以使用Tomcat的CGI支持或者通過將PHP解釋器與Tomcat集成來實現。

方法一：使用Tomcat的CGI支持

1. 將PHP解釋器安裝在服務器上，確保在系統路徑中可以找到php可執行文件。
2. 在Tomcat的webapps目錄下創建一個CGI目錄，并在該目錄中放置PHP腳本文件。
3. 在Tomcat的conf目錄下的web.xml文件中添加以下配置：

<servlet>
    <servlet-name>cgi</servlet-name>
    <servlet-class>org.apache.catalina.servlets.CGIServlet</servlet-class>
    <init-param>
        <param-name>debug</param-name>
        <param-value>0</param-value>
    </init-param>
    <init-param>
        <param-name>cgiPathPrefix</param-name>
        <param-value>WEB-INF/cgi</param-value>
    </init-param>
</servlet>
<servlet-mapping>
    <servlet-name>cgi</servlet-name>
    <url-pattern>/cgi-bin/*</url-pattern>
</servlet-mapping>

4. 在webapps目錄下的WEB-INF目錄中創建一個cgi目錄，并在該目錄下放置php腳本文件。
5. 在瀏覽器中訪問http://localhost:8080/cgi-bin/test.php，即可運行php腳本。

方法二：通過將PHP解釋器與Tomcat集成來實現

1. 下載并安裝用于將PHP與Tomcat集成的插件，如Quercus或PHP/Java Bridge。
2. 在Tomcat中配置插件，以使Tomcat能夠執行PHP腳本。
3. 將PHP腳本文件放置在Tomcat的webapps目錄下，并在瀏覽器中訪問對應的URL來運行PHP腳本。

無論使用哪種方法，在配置完成后，即可在Tomcat中成功運行PHP腳本。