當使用JdbcTemplate和MyBatis同時操作數據庫時，可能會遇到一些沖突。以下是一些建議來解決這些沖突：

1. 確保事務管理器配置正確：在Spring配置文件中，需要為JdbcTemplate和MyBatis分別配置不同的事務管理器。例如：

<!-- JdbcTemplate transaction manager -->
<bean id="jdbcTransactionManager" class="org.springframework.jdbc.datasource.DataSourceTransactionManager">
   <property name="dataSource" ref="dataSource" />
</bean>

<!-- MyBatis transaction manager -->
<bean id="myBatisTransactionManager" class="org.mybatis.spring.transaction.SpringManagedTransactionFactory" />

2. 使用@Transactional注解：在需要進行事務管理的方法上添加@Transactional注解，并指定使用哪個事務管理器。例如：

@Service
public class MyService {
    @Autowired
    private JdbcTemplate jdbcTemplate;

    @Autowired
    private MyBatisMapper myBatisMapper;

    @Transactional(value = "jdbcTransactionManager")
    public void doSomethingWithJdbcTemplate() {
        // ...
    }

    @Transactional(value = "myBatisTransactionManager")
    public void doSomethingWithMyBatis() {
        // ...
    }
}

3. 避免在同一個方法中使用JdbcTemplate和MyBatis：盡量將使用JdbcTemplate和MyBatis的代碼分開，以避免在同一個方法中使用兩者，從而降低沖突的可能性。

4. 使用SqlSessionTemplate：在使用MyBatis時，可以使用SqlSessionTemplate來替代直接使用SqlSession。SqlSessionTemplate提供了與JdbcTemplate類似的功能，可以更好地與Spring集成。例如：

@Service
public class MyService {
    @Autowired
    private JdbcTemplate jdbcTemplate;

    @Autowired
    private SqlSessionTemplate sqlSessionTemplate;

    public void doSomething() {
        // 使用JdbcTemplate
        jdbcTemplate.update("...");

        // 使用MyBatis
        MyBatisMapper mapper = sqlSessionTemplate.getMapper(MyBatisMapper.class);
        mapper.doSomething();
    }
}

5. 如果仍然遇到問題，可以考慮將JdbcTemplate和MyBatis分別放在不同的模塊中，以降低沖突的可能性。

通過以上方法，可以有效地解決JdbcTemplate與MyBatis集成沖突的問題。