在Java Web開發中，使用Bootstrap定制樣式的方法有以下幾種：

1. 使用Bootstrap官方提供的定制工具： 訪問Bootstrap官方網站（https://getbootstrap.com/），點擊"Customize"按鈕，進入定制頁面。在這里，你可以根據需要選擇或修改Bootstrap的組件、顏色、字體等樣式。定制完成后，點擊"Compile and Download"按鈕下載定制好的Bootstrap文件。然后將這些文件引入到你的項目中，替換原有的Bootstrap文件。

2. 使用Sass/SCSS定制： Bootstrap支持使用Sass/SCSS進行樣式定制。首先，確保你已經安裝了Node.js和npm。然后，通過npm安裝Bootstrap和Sass：

   npm install bootstrap
   npm install sass
   

   接下來，創建一個名為custom.scss的新文件，并在其中導入Bootstrap的Sass文件。在這個文件中，你可以根據需要覆蓋Bootstrap的默認變量和樣式。例如：

   // 導入Bootstrap的Sass文件
   @import '~bootstrap/scss/bootstrap';
   
   // 覆蓋默認變量
   $primary: #your-color;
   $font-family-base: 'your-font', sans-serif;
   
   // 覆蓋默認樣式
   .btn {
     border-radius: 0;
   }
   

   最后，使用Sass編譯custom.scss文件生成定制的CSS文件：

   npx sass custom.scss custom.css
   

   將生成的custom.css文件引入到你的項目中，替換原有的Bootstrap文件。

3. 使用CSS覆蓋樣式： 如果你不想使用Sass/SCSS，也可以直接在項目中創建一個新的CSS文件，用于覆蓋Bootstrap的默認樣式。例如，創建一個名為custom.css的文件，并在其中添加以下內容：

   /* 覆蓋默認樣式 */
   .btn {
     background-color: #your-color;
     border-radius: 0;
   }
   

   然后，在HTML文件中，確保將custom.css文件放在Bootstrap的CSS文件之后，以便覆蓋原有的樣式：

   <link rel="stylesheet" href="path/to/bootstrap.min.css">
   <link rel="stylesheet" href="path/to/custom.css">
   

通過以上方法，你可以根據項目需求定制Bootstrap樣式。在實際開發過程中，可以根據項目的復雜度和需求選擇合適的定制方法。