Flowchart.js是一個用于創建流程圖的JavaScript庫，它本身并不提供自動對齊和分布節點的功能。但是你可以通過編寫自定義的代碼來實現這些功能。

以下是一個簡單的示例代碼，演示如何利用Flowchart.js的API來實現自動對齊和分布節點：

// 創建一個流程圖
var chart = new flowchart.Chart({
  container: document.getElementById('myChart'),
  data: {
    nodes: [
      {id: 'node1', text: 'Node 1', x: 100, y: 100},
      {id: 'node2', text: 'Node 2', x: 200, y: 200},
      {id: 'node3', text: 'Node 3', x: 300, y: 300}
    ]
  }
});

// 自定義函數，用于將節點自動對齊并分布
function alignAndDistributeNodes() {
  // 獲取所有節點
  var nodes = chart.getNodes();

  // 計算節點的平均位置
  var totalX = 0;
  var totalY = 0;
  nodes.forEach(function(node) {
    totalX += node.x;
    totalY += node.y;
  });
  var avgX = totalX / nodes.length;
  var avgY = totalY / nodes.length;

  // 對齊所有節點到平均位置
  nodes.forEach(function(node) {
    node.x = avgX;
    node.y = avgY;
    chart.updateNode(node.id, node);
  });

  // 重新繪制流程圖
  chart.draw();
}

// 調用自定義函數
alignAndDistributeNodes();

在這個例子中，我們首先創建了一個簡單的流程圖，然后定義了一個自定義函數alignAndDistributeNodes，該函數會計算所有節點的平均位置，并將所有節點對齊到該位置。最后，我們調用這個函數來實現自動對齊和分布節點。

你可以根據自己的需求修改和擴展這個示例代碼，以實現更復雜的自動對齊和分布節點的功能。