在Android系統中，使用System.exit(0)會導致整個系統退出，這會影響到其他正在運行的應用和整個系統。為了避免這種情況，你可以嘗試以下方法：

1. 使用finish()方法關閉當前應用，而不是使用System.exit(0)。這將只關閉當前應用，而不會影響到其他應用和系統。

finish();

2. 如果你想關閉當前Activity并返回到上一個Activity，可以使用onBackPressed()方法。這將只返回到上一個Activity，而不會關閉整個應用。

@Override
public void onBackPressed() {
    super.onBackPressed();
    // 在這里處理返回事件，例如關閉當前Activity
}

3. 如果你想關閉當前應用的所有Activity并返回到啟動器，可以使用ActivityManager。但請注意，這種方法需要應用具有系統簽名權限，可能會導致安全問題。

ActivityManager activityManager = (ActivityManager) getSystemService(Context.ACTIVITY_SERVICE);
List<ActivityManager.RunningTaskInfo> runningTasks = activityManager.getRunningTasks(Integer.MAX_VALUE);

for (ActivityManager.RunningTaskInfo task : runningTasks) {
    ComponentName baseActivity = task.baseActivity;
    ComponentName topActivity = task.topActivity;

    if (topActivity.getClassName().equals("com.example.myapp.MyApplication")) {
        activityManager.killBackgroundProcesses(topActivity.getPackageName());
        break;
    }
}

請注意，從Android 5.0（Lollipop）開始，使用ActivityManager.killBackgroundProcesses()方法已經被棄用，因為它可能會導致應用數據丟失。在這種情況下，你可以考慮使用其他方法，如finish()或onBackPressed()，來關閉當前應用。