在Java中，處理大文件的Base64壓縮可以通過以下方法完成：

1. 使用Java的IO流逐塊讀取大文件，并進行Base64編碼和解碼。
2. 在讀取大文件時，可以使用緩沖區來減少IO操作次數，提高性能。
3. 使用GZIP壓縮算法對文件進行壓縮，然后再進行Base64編碼。
4. 在解碼時，先進行Base64解碼，然后再使用GZIP解壓縮算法進行解壓縮。

下面是一個示例代碼，演示了如何處理大文件的Base64壓縮：

import java.io.*;
import java.util.Base64;
import java.util.zip.GZIPInputStream;
import java.util.zip.GZIPOutputStream;

public class Base64Compression {

    public static void main(String[] args) {
        String inputFile = "largeFile.txt";
        String compressedFile = "compressedFile.txt";
        String decompressedFile = "decompressedFile.txt";

        // Compress file using Base64 and GZIP
        try (InputStream input = new BufferedInputStream(new FileInputStream(inputFile));
             OutputStream output = new BufferedOutputStream(new GZIPOutputStream(new FileOutputStream(compressedFile)))) {
            byte[] buffer = new byte[1024];
            int bytesRead;
            while ((bytesRead = input.read(buffer)) != -1) {
                output.write(buffer, 0, bytesRead);
            }
        } catch (IOException e) {
            e.printStackTrace();
        }

        // Encode compressed file to Base64
        try (InputStream input = new BufferedInputStream(new FileInputStream(compressedFile));
             ByteArrayOutputStream output = new ByteArrayOutputStream()) {
            byte[] buffer = new byte[1024];
            int bytesRead;
            while ((bytesRead = input.read(buffer)) != -1) {
                output.write(buffer, 0, bytesRead);
            }
            String encodedFile = Base64.getEncoder().encodeToString(output.toByteArray());
            System.out.println("Encoded file length: " + encodedFile.length());
        } catch (IOException e) {
            e.printStackTrace();
        }

        // Decode Base64 to decompressed file
        try (OutputStream output = new BufferedOutputStream(new FileOutputStream(decompressedFile));
             ByteArrayInputStream input = new ByteArrayInputStream(Base64.getDecoder().decode(encodedFile))) {
            byte[] buffer = new byte[1024];
            int bytesRead;
            while ((bytesRead = input.read(buffer)) != -1) {
                output.write(buffer, 0, bytesRead);
            }
        } catch (IOException e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }
}

在上面的示例代碼中，首先將大文件使用GZIP進行壓縮，然后再對壓縮后的文件進行Base64編碼。解碼時，先將Base64編碼的字符串解碼，再使用GZIP進行解壓縮，最終得到原始的大文件內容。這樣可以有效地處理大文件的Base64壓縮。