在Java中執行Linux命令有以下幾種方法：

1. 使用Runtime類的exec()方法：這是最簡單的方法，它可以直接執行一個命令，并返回一個Process對象，可以通過該對象獲取命令執行的結果。

String command = "ls -a";
Process process = Runtime.getRuntime().exec(command);
// 獲取命令執行的輸出結果
InputStream inputStream = process.getInputStream();
BufferedReader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(inputStream));
String line;
while ((line = reader.readLine()) != null) {
System.out.println(line);
}
// 等待命令執行完成
int exitCode = process.waitFor();
System.out.println("Exit code: " + exitCode);

2. 使用ProcessBuilder類：這是一個更靈活的方法，可以通過ProcessBuilder對象設置命令參數、工作目錄等，并執行命令。

List<String> command = Arrays.asList("ls", "-a");
ProcessBuilder processBuilder = new ProcessBuilder(command);
// 設置工作目錄
processBuilder.directory(new File("/path/to/directory"));
// 執行命令
Process process = processBuilder.start();
// 獲取命令執行的輸出結果，等待命令執行完成
InputStream inputStream = process.getInputStream();
BufferedReader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(inputStream));
String line;
while ((line = reader.readLine()) != null) {
System.out.println(line);
}
int exitCode = process.waitFor();
System.out.println("Exit code: " + exitCode);

3. 使用Apache Commons Exec庫：這是一個更高級的庫，可以更方便地執行命令，并提供更多的功能，如處理命令的輸出、錯誤輸出等。

首先需要在項目中引入Apache Commons Exec庫的依賴，然后可以使用CommandLine對象來執行命令。

CommandLine commandLine = new CommandLine("ls");
commandLine.addArgument("-a");
DefaultExecutor executor = new DefaultExecutor();
// 設置工作目錄
executor.setWorkingDirectory(new File("/path/to/directory"));
// 執行命令
ByteArrayOutputStream outputStream = new ByteArrayOutputStream();
PumpStreamHandler streamHandler = new PumpStreamHandler(outputStream);
executor.setStreamHandler(streamHandler);
int exitCode = executor.execute(commandLine);
System.out.println(outputStream.toString());
System.out.println("Exit code: " + exitCode);

以上是三種常用的方法，可以根據需要選擇適合的方法來執行Linux命令。