在MyBatis中，可以使用批量更新操作來更新幾千條數據。以下是一種實現方式：

1. 在Mapper接口中定義一個批量更新的方法，如下所示：

public interface UserMapper {
    void updateBatch(List<User> userList);
}

2. 在對應的Mapper XML 文件中編寫批量更新的 SQL 語句，如下所示：

<update id="updateBatch" parameterType="java.util.List">
    update user
    <set>
        <foreach collection="list" item="item" separator="," >
            username = #{item.username},
            password = #{item.password}
        </foreach>
    </set>
    where id in
    <foreach collection="list" item="item" open="(" close=")" separator=",">
        #{item.id}
    </foreach>
</update>

3. 在代碼中調用批量更新方法，如下所示：

List<User> userList = new ArrayList<>();
// 添加需要更新的用戶數據到userList中

try(SqlSession sqlSession = sqlSessionFactory.openSession()) {
    UserMapper userMapper = sqlSession.getMapper(UserMapper.class);
    userMapper.updateBatch(userList);
    sqlSession.commit();
} catch (Exception e) {
    e.printStackTrace();
}

通過以上步驟，就可以實現在MyBatis中批量更新幾千條數據的操作。需要注意的是，具體的 SQL 語句和參數設置需要根據實際情況進行調整。